RefSeq NC_004981
DoriC accession number pORI00000026
OriC length 1241 nt
OriC AT content 0.6454
The location of oriC region 1935..1128 nt
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OriC map
OriC sequences
AAGTTGAAATTATAGCTAGTGTTTTTAGTGAAAAATCAGTTCAGAAAAAAGTAAATAATTTTATTGATTATTTAAATGACAATAATTTTGAAGTATTGGAAGTTCAATATAGGCCTACATTTTTTTATTGCTCTGCTATGATTGTTTATCGATAGTTTTTTATACAGATAAGCGTGCGACGCTTGCTCTTTCCGAGGAGGAAGTCATGCTGACAAGCACGGCAGAGCCTCCGCATGAAATGCTCTCAATGAAATTGCCGGCGGAGCTTTTTTGAGCTTGTGCCACTTGCGAAAAAAACAAGAACAAAAGAGACAGGAAACTGTCTTTTTTTGCTTGCTTGGGGATTGGGGCAACGCCCCAAAAATAAAAAGAATCGTCTGAAACGAGGAACAAACTAAAATGTAAATTTTAGTTGTTACCGAGTGGAAGATGAATACTTTTTAACCTATGTGTATACACACATAGTAAGCTCGCTATAATACTTTATAACGTTTTTATTTACATGAGCAAAGCGAGTTTTTCCAACACGTTTAATCTAAAATATTGGCAATTTATACCATGATTTTCATGGTATGTAAGTGCGCCCTTAGGAAAATAATTTGAATATATTTCAGATTTTCAATCTGACTGCTCCTGTCATCGAGCAGACCGATGAGGAAAACAAAAAGAGGACTAAACAAAAAAGTTTAGTCCTCTTTTTGTTTTGAATAGTTCTAGAACGTCATATTTTGCGTTTTAAGCAATTTTGACTAACTAGGCGGGGATTTTTACTTAGAAATTATTCAAAACGTCTGTAAAGTGCTTAAAATCGTTTCTAAGAGCTTTTAGCGTTTATTTCGTTTAGTTATCGGCATAATCGTTAAAACAGGCGTTATCGTAGCGGAAAAGCCCTTGAGCGTAGCGTGGCTTTGCAGTGAAGATGTTGTCTGTTAGATTATGAAAGCCGATAACTGAATGAAATAATAAGCGTAGCGCCCCTTATTTCGGTCGGAGGAGGCTCAAGGGAGTTTGAGGGAATGAAATTCCCTCATGGTTTTAAAATTGCTTGCAATTTTGCCGAGCGGTAGCGCTGGAAAATTTTTGAAAAAAATTTGGAATTTGGAAAAATGGGGGGGTACTACGACCCCCCCCTATGTGGTAATTTGGTAACTTGGTCAAAATTGATACTAATATATATTAAAACAGCACAAAACAGAATCTTATGATATAATAAGATATACTGAAATTTGAAGGAGTAAAAA
AAGTTGAAATTATAGCTAGTGTTTTTAGTGAAAAATCAGTTCAGAAAAAAGTAAATAATTTTATTGATTATTTAAATGACAATAATTTTGAAGTATTGGAAGTTCAATATAGGCCTACATTTTTTTATTGCTCTGCTATGATTGTTTATCGATAGTTTTTTATACAGATAAGCGTGCGACGCTTGCTCTTTCCGAGGAGGAAGTCATGCTGACAAGCACGGCAGAGCCTCCGCATGAAATGCTCTCAATGAAATTGCCGGCGGAGCTTTTTTGAGCTTGTGCCACTTGCGAAAAAAACAAGAACAAAAGAGACAGGAAACTGTCTTTTTTTGCTTGCTTGGGGATTGGGGCAACGCCCCAAAAATAAAAAGAATCGTCTGAAACGAGGAACAAACTAAAATGTAAATTTTAGTTGTTACCGAGTGGAAGATGAATACTTTTTAACCTATGTGTATACACACATAGTAAGCTCGCTATAATACTTTATAACGTTTTTATTTACATGAGCAAAGCGAGTTTTTCCAACACGTTTAATCTAAAATATTGGCAATTTATACCATGATTTTCATGGTATGTAAGTGCGCCCTTAGGAAAATAATTTGAATATATTTCAGATTTTCAATCTGACTGCTCCTGTCATCGAGCAGACCGATGAGGAAAACAAAAAGAGGACTAAACAAAAAAGTTTAGTCCTCTTTTTGTTTTGAATAGTTCTAGAACGTCATATTTTGCGTTTTAAGCAATTTTGACTAACTAGGCGGGGATTTTTACTTAGAAATTATTCAAAACGTCTGTAAAGTGCTTAAAATCGTTTCTAAGAGCTTTTAGCGTTTATTTCGTTTAGTTATCGGCATAATCGTTAAAACAGGCGTTATCGTAGCGGAAAAGCCCTTGAGCGTAGCGTGGCTTTGCAGTGAAGATGTTGTCTGTTAGATTATGAAAGCCGATAACTGAATGAAATAATAAGCGTAGCGCCCCTTATTTCGGTCGGAGGAGGCTCAAGGGAGTTTGAGGGAATGAAATTCCCTCATGGTTTTAAAATTGCTTGCAATTTTGCCGAGCGGTAGCGCTGGAAAATTTTTGAAAAAAATTTGGAATTTGGAAAAATGGGGGGGTACTACGACCCCCCCCTATGTGGTAATTTGGTAACTTGGTCAAAATTGATACTAATATATATTAAAACAGCACAAAACAGAATCTTATGATATAATAAGATATACTGAAATTTGAAGGAGTAAAAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CGCCCC

StartP-valueSite
9731.51e-05ATAAGCGTAGCGCCCCTTATTTCGGT
3541.51e-05ATTGGGGCAACGCCCCAAAAATAAAA
11242.61e-05GGTACTACGACCCCCCCCTATGTGGT
5825.83e-05TATGTAAGTGCGCCCTTAGGAAAATA

Motif CGGHRGAGCY

StartP-valueSite
2191.55e-07CTGACAAGCACGGCAGAGCCTCCGCATGAA
2586.96e-07ATGAAATTGCCGGCGGAGCTTTTTTGAGCT
9893.27e-06TTATTTCGGTCGGAGGAGGCTCAAGGGAGT
8814.50e-06GTTATCGTAGCGGAAAAGCCCTTGAGCGTA
10627.89e-06TTTTGCCGAGCGGTAGCGCTGGAAAATTTT

Motif GCTTGC

StartP-valueSite
10449.47e-05TTTTAAAATTGCTTGCAATTTTGCCG
3329.47e-05GTCTTTTTTTGCTTGCTTGGGGATTG
1819.47e-05AGCGTGCGACGCTTGCTCTTTCCGAG
4691.39e-04CACATAGTAAGCTCGCTATAATACTT
1722.01e-04ATACAGATAAGCGTGCGACGCTTGCT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000026 100.0 1241 0 0 1 1241 1 1241 0.0 2292
pORI00000003 94.118 323 15 4 796 1115 289 610 0.0 488
pORI00000252 96.599 294 9 1 823 1115 519 812 0.0 486
pORI00000249 96.635 208 5 2 810 1016 151 357 0.0 344
pORI00000249 93.893 131 7 1 611 740 29 159 0.0 196
pORI00000375 94.22 173 9 1 576 747 840 668 0.0 263
pORI00000065 78.134 343 59 14 702 1037 248 581 0.0 204