RefSeq NC_018608.1
Accession number NC_018608.1
DoriC accession number ORI96010301
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2782101..517 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTDTGDAWAAGTTATCCAMYKMTK

StartP-valueSite
6602.39e-11TTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGT
5225.39e-11AAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAA
6041.37e-10TAACTACTAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAACT
3858.45e-10GATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATA
3008.49e-09TGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAATTCTTATACATACTT

Motif TGTGGATAAYTAWWAA

StartP-valueSite
4301.56e-08TTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAA
5883.70e-08ATAAAAATACTGTGCATAACTACTAAGCAGGATAAA
6381.32e-07GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGT
6912.69e-07CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAA
4971.27e-06GTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTG

Motif CCSAAGC

StartP-valueSite
2788.08e-06TGATTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTT
3461.74e-05TAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010301 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
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ORI92210347 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI92010319 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI90010305 98.63 730 10 0 1 730 259 988 0.0 1293
ORI10010066 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
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ORI10010019 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI10010017 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010086 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010070 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010198 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282
ORI96010084 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282
ORI96010082 98.219 730 13 0 1 730 1 730 0.0 1277
ORI96010078 98.219 730 13 0 1 730 730 1 0.0 1277
ORI96010076 98.219 730 13 0 1 730 1 730 0.0 1277
ORI96010066 98.219 730 13 0 1 730 1 730 0.0 1277
ORI10010033 98.219 730 13 0 1 730 1 730 0.0 1277