RefSeq GCF_000189455.2
Accession number NZ_CP025395.1
DoriC accession number ORI97014111
OriC length 731 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2791196..516 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmhGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaa
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
rpmHGCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTTACAATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATACACACATTAAAAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5245.47e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6391.25e-06GTTATTGACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4311.25e-06TTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5891.55e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6922.59e-06TTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AAGTTATMCACTKWTK

StartP-valueSite
6699.85e-10GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTGT
3945.39e-09ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATA
6138.18e-09AAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTGACT
3098.97e-07ATGTTCGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTT
4561.08e-06ATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATAT

Motif CCSAAGC

StartP-valueSite
2797.40e-06TGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTATTT
3471.54e-05TAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010080 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI96010074 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI93010600 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI92210347 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI92010319 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI90010305 98.632 731 9 1 1 731 259 988 0.0 1293
ORI10010066 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI10010035 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI10010019 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI10010017 98.632 731 9 1 1 731 1 730 0.0 1293
ORI96010086 98.495 731 10 1 1 731 1 730 0.0 1288
ORI96010082 98.495 731 10 1 1 731 1 730 0.0 1288
ORI96010078 98.495 731 10 1 1 731 730 1 0.0 1288
ORI96010076 98.495 731 10 1 1 731 1 730 0.0 1288
ORI96010070 98.495 731 10 1 1 731 1 730 0.0 1288
ORI96010066 98.495 731 10 1 1 731 1 730 0.0 1288
ORI10010033 98.495 731 10 1 1 731 1 730 0.0 1288
ORI96010198 98.358 731 11 1 1 731 1 730 0.0 1282
ORI96010084 98.358 731 11 1 1 731 1 730 0.0 1282
ORI96010068 98.222 731 12 1 1 731 1 730 0.0 1277
ORI95011011 98.222 731 12 1 1 731 1 730 0.0 1277