RefSeq NC_016912.1
Accession number NC_016912.1
DoriC accession number ORI95011011
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2692357..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.12e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.15e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.15e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.46e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAAG
6913.19e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AAGTTATMCACTKHTK

StartP-valueSite
6681.71e-10GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGT
3936.60e-09ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATA
6129.96e-09AAGCAAGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAACT
3086.50e-07ATGTTCGAACACCTTATACAGTTCTTATACATACTT
4551.22e-06ATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATAT

Motif GGTSYG

StartP-valueSite
2753.78e-05CCATGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGT
6577.91e-05TTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI95011011 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI92010323 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
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ORI10010031 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI92210360 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
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ORI96010080 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010074 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI93010600 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI92210347 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI92010319 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI90010305 99.041 730 7 0 1 730 259 988 0.0 1310
ORI10010066 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010035 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010019 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010017 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010198 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010084 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010078 98.356 730 12 0 1 730 730 1 0.0 1282
ORI96010070 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282