RefSeq GCF_000160335.2
Accession number NC_022113.1
DoriC accession number ORI97010495
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2756733..543 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.01e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.14e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.14e-06TTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.45e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6913.17e-06TTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AAGTTATCCACNG

StartP-valueSite
6685.93e-09GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTT
6121.27e-08AAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTA
3934.00e-07ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACACTT
4741.50e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACA

Motif ASCATGAG

StartP-valueSite
2825.67e-06TTTGATCCAAAGCATGAGTGTTTACAAT
2641.21e-05TCATAACATCACCATGAGTTTGATCCAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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ORI96010078 99.863 730 1 0 1 730 730 1 0.0 1343
ORI96010076 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI96010066 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI10010033 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI96010084 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI96010080 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI96010074 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI93010600 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI92210347 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI92010319 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI90010305 98.904 730 8 0 1 730 259 988 0.0 1304
ORI10010066 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI10010035 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI10010019 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI10010017 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI96010086 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010070 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010198 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI10010177 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010068 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288