RefSeq NC_012722
DoriC accession number pORI00000250
OriC length 1566 nt
OriC AT content 0.6194
The location of oriC region 2370..1511 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
AGATAATACCAGGGTATTATCAACGACAAAACCGTTGGATATACCCTGATTTTTTGTTGTCGCCATTGGCGACTTCTGATACAGATTTTTTGGTTTTAGCACTACTCCAATTTATTTGGAGTGTAAGTGCGCCTTGAACTAATATTTTTGAATTTTGTCATTGTCGAAATATAAGACAATGCGCACTTACACGTCACTTTCATGACGTCGTGCGTTCTGACTGAAAAACGTCAGAAGGGCGCACTTATACTCCACGAAAATAAATGGGGTGTAAGTTGCTTAAAACCTGTATCAGAATTCGCTCCGCTCAAACTAAAACTGACGGGGGTCAGTTTGAAACCCAAAAAGCAGATAAGTTCAGTCGTAAACTCCTTCGAACTTTTCTCCTTTTTGGGTTGCTCTCAAAAGCCCAAAATTGCCTTCTAAGCCATTTTAGGAATTAACAAGCTATTTCGTCGTCTGTCAACGGTAAATCGACGTAGATAGCCTTATTGAGCCGTACAGGCGAAATTAGACTATCTAGGAGGCTTTAAGGAGTTGATAGACTTTGCAAATTGAAAGCTAAACGGCGGAAAGCAGCTTGCCTGTTTTCCCGAGCCCGACTGGCGGCGAAGTCGAAACGGTCAAGCTGGTTCAGCTTGTCAGGTTTGGGTGAAACCCAAGGTCTTACTTTTTTGGTCGTTAAAACTGGAAAATTTCACAAACTTTTTAAGCGGGTCTCTCTAACTAGCCCGCTACCCGTTTGAAAATCAAACCTTTTGCTTTTTTGTTCACATGAAAAAATGTGGTAATGTTCTAGTGTTTTAGAAAGAGATTTAAAGGGGATTAATAATGCCGAGGATTGACGAACGTAGTTGGAAAAAGATTTTTGAATTGGGTAATAACGGTAAATACGATGATGAAGCGTATGCTGAGATTCTTGCTACAGTATTGAATTTGCGTGTTGAAAAAGGCTTAACTCAAAGTGACGTTGCGAGAATATCTGGTTTATCTACGAGTATGATCTCTAAAATTGAAAGTCAATATACAGTACCGAGTGTAAAAAATTTCTTACGATATATTTTCGCCTTAGATTTGGATTGGGAACTCGTTCATAAACGTTAATTGAATTTTGGGTTTAAAAAAGAGGTTCAGTATGAACCTCTTTTTTGGGGTTTGAAAGTGACGTTTTTTGTCACTTTCCTCTTATCTTGATACTATTAGAAACAACGTCATTTTAAAAAACTGGGATAAACCCTTGACACAACTGGACTTAGGCGTATTATGAGTTTATAAAATGAATAAAGAAAAAACCCACGTGAGAATTCCTAGTTTGGCGACCCGGAACACGCGAGTTAATCTTGAATATTCGTATTTACTAGACATAGTTTAAAGCTTGAGTTAGTAAGCGTCAAGACCTTAGTTTTAGTAAATACATAAAAGATTAGCTCTTCTCACGTGGTTGGATGAGAGGAGCTTTTTAGTTTGGCTGATAGAAAAGTTTTAGTTGATCGATCGCAGTCGGGAAAAGTACGACCATGGCGAGAACATAAGTTAGAGAATTTACAGTATGGTGATTATTTACAA
AGATAATACCAGGGTATTATCAACGACAAAACCGTTGGATATACCCTGATTTTTTGTTGTCGCCATTGGCGACTTCTGATACAGATTTTTTGGTTTTAGCACTACTCCAATTTATTTGGAGTGTAAGTGCGCCTTGAACTAATATTTTTGAATTTTGTCATTGTCGAAATATAAGACAATGCGCACTTACACGTCACTTTCATGACGTCGTGCGTTCTGACTGAAAAACGTCAGAAGGGCGCACTTATACTCCACGAAAATAAATGGGGTGTAAGTTGCTTAAAACCTGTATCAGAATTCGCTCCGCTCAAACTAAAACTGACGGGGGTCAGTTTGAAACCCAAAAAGCAGATAAGTTCAGTCGTAAACTCCTTCGAACTTTTCTCCTTTTTGGGTTGCTCTCAAAAGCCCAAAATTGCCTTCTAAGCCATTTTAGGAATTAACAAGCTATTTCGTCGTCTGTCAACGGTAAATCGACGTAGATAGCCTTATTGAGCCGTACAGGCGAAATTAGACTATCTAGGAGGCTTTAAGGAGTTGATAGACTTTGCAAATTGAAAGCTAAACGGCGGAAAGCAGCTTGCCTGTTTTCCCGAGCCCGACTGGCGGCGAAGTCGAAACGGTCAAGCTGGTTCAGCTTGTCAGGTTTGGGTGAAACCCAAGGTCTTACTTTTTTGGTCGTTAAAACTGGAAAATTTCACAAACTTTTTAAGCGGGTCTCTCTAACTAGCCCGCTACCCGTTTGAAAATCAAACCTTTTGCTTTTTTGTTCACATGAAAAAATGTGGTAATGTTCTAGTGTTTTAGAAAGAGATTTAAAGGGGATTAATAATGCCGAGGATTGACGAACGTAGTTGGAAAAAGATTTTTGAATTGGGTAATAACGGTAAATACGATGATGAAGCGTATGCTGAGATTCTTGCTACAGTATTGAATTTGCGTGTTGAAAAAGGCTTAACTCAAAGTGACGTTGCGAGAATATCTGGTTTATCTACGAGTATGATCTCTAAAATTGAAAGTCAATATACAGTACCGAGTGTAAAAAATTTCTTACGATATATTTTCGCCTTAGATTTGGATTGGGAACTCGTTCATAAACGTTAATTGAATTTTGGGTTTAAAAAAGAGGTTCAGTATGAACCTCTTTTTTGGGGTTTGAAAGTGACGTTTTTTGTCACTTTCCTCTTATCTTGATACTATTAGAAACAACGTCATTTTAAAAAACTGGGATAAACCCTTGACACAACTGGACTTAGGCGTATTATGAGTTTATAAAATGAATAAAGAAAAAACCCACGTGAGAATTCCTAGTTTGGCGACCCGGAACACGCGAGTTAATCTTGAATATTCGTATTTACTAGACATAGTTTAAAGCTTGAGTTAGTAAGCGTCAAGACCTTAGTTTTAGTAAATACATAAAAGATTAGCTCTTCTCACGTGGTTGGATGAGAGGAGCTTTTTAGTTTGGCTGATAGAAAAGTTTTAGTTGATCGATCGCAGTCGGGAAAAGTACGACCATGGCGAGAACATAAGTTAGAGAATTTACAGTATGGTGATTATTTACAA

AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GCGCACTTAYACKYCAC

StartP-valueSite
1813.25e-11ATAAGACAATGCGCACTTACACGTCACTTTCATGACG
2396.13e-11CGTCAGAAGGGCGCACTTATACTCCACGAAAATAAAT

Motif AAACCC

StartP-valueSite
12901.35e-04AATAAAGAAAAAACCCACGTGAGAAT
12321.35e-04AAACTGGGATAAACCCTTGACACAAC
6551.35e-04GGTTTGGGTGAAACCCAAGGTCTTAC
3371.35e-04GGTCAGTTTGAAACCCAAAAAGCAGA

Motif GAGCCSKACWGGCG

StartP-valueSite
5957.20e-10CTGTTTTCCCGAGCCCGACTGGCGGCGAAGTCGA
4943.36e-09TAGCCTTATTGAGCCGTACAGGCGAAATTAGACT

The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000250 100.0 1566 0 0 1 1566 1 1566 0.0 2892
pORI00000082 85.209 311 43 3 1152 1460 1029 1338 0.0 316
pORI00000067 84.858 317 36 12 1151 1462 540 849 0.0 309
pORI00000068 89.157 83 8 1 50 132 33 114 1.94e-22 102
pORI00000963 80.315 127 11 5 10 135 548 435 7.01e-17 84
pORI00000811 80.315 127 11 5 10 135 523 410 7.01e-17 84
pORI00000444 79.699 133 13 5 1 132 1 120 7.01e-17 84
pORI00000649 80.328 122 10 5 10 130 502 394 9.07e-16 81
pORI00000460 79.389 131 13 5 1 130 1 118 9.07e-16 81
pORI00000368 79.389 131 13 5 1 130 1 118 9.07e-16 81
pORI00000042 79.389 131 13 5 1 130 1 118 9.07e-16 81