RefSeq NC_014367
DoriC accession number pORI00000067
OriC length 851 nt
OriC AT content 0.6181
The location of oriC region 2150..279 nt
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OriC map
OriC sequences
ACACGTAAACGGTAAAAATAATCTGCAAGATTTTTTCTACTAGTTACAAAAAAAGATCCTTTTAAGGATCTTTTTTTGTGCTTTCTATAATTACAGTAGTAAATATCTATTTACCGCATTAAATCTGATACTTAACAAAAAGTAGAACTCCTTATAAAATACACGAATACTAGTAAAAATCCCGTATTAAATTAAAAGAAGCACAGTTTGTGTGTATCAATTGAAAGAATATAAATGACTTAGATTAAAATTACACTTTTTAGTTTGCACTCCTTCGAACTTAATCCTTGCACCACGTTGCAACTAAAAGCGGGTACGAGCTGGTAGTCAACGGTACCGGAACGACCAACGGGAGCGAGGATAAGGAGTTGACTAGCTAACTAAACCCAGACACTGAATTGGCTGAAAGCCAAAGTTTCTTAAACTTTGCTTTCCTGCCCTCACGGCGAGTGATGGGGTGAGTATGAGCGGGAGCCCCCGCTCATGTTTCACGGTCAAGCTGGTTCAGCTTGGTCGGGGTTCGGGGCGACAGCGCCCGAGGGGTTGAAACTGGCGTTTTTTTGCCAGTTTCCTCTTATCTTGATACATATAGAAACAACAAGTTTTTTCAAAACTGCCTTTAGCCCTTGACATGACTGGCTTGAAGCGTATTATTGGTTAATAAAGAAAACAATAAAAAAACCCACGTGAGAATTCCTAGTTTGGCGACCCGGAACACGTGAGTTAATCTTCAAAATTCGTATTTACTAGACTTAGTTTAAGACTTGATTTAGTAATCGTCAAGTCCTTACTTTTAGTAAATACATAAAAGATTAACTCTTCTCACGTGGCTAGTGAGAGGAGTTTTTAAT
ACACGTAAACGGTAAAAATAATCTGCAAGATTTTTTCTACTAGTTACAAAAAAAGATCCTTTTAAGGATCTTTTTTTGTGCTTTCTATAATTACAGTAGTAAATATCTATTTACCGCATTAAATCTGATACTTAACAAAAAGTAGAACTCCTTATAAAATACACGAATACTAGTAAAAATCCCGTATTAAATTAAAAGAAGCACAGTTTGTGTGTATCAATTGAAAGAATATAAATGACTTAGATTAAAATTACACTTTTTAGTTTGCACTCCTTCGAACTTAATCCTTGCACCACGTTGCAACTAAAAGCGGGTACGAGCTGGTAGTCAACGGTACCGGAACGACCAACGGGAGCGAGGATAAGGAGTTGACTAGCTAACTAAACCCAGACACTGAATTGGCTGAAAGCCAAAGTTTCTTAAACTTTGCTTTCCTGCCCTCACGGCGAGTGATGGGGTGAGTATGAGCGGGAGCCCCCGCTCATGTTTCACGGTCAAGCTGGTTCAGCTTGGTCGGGGTTCGGGGCGACAGCGCCCGAGGGGTTGAAACTGGCGTTTTTTTGCCAGTTTCCTCTTATCTTGATACATATAGAAACAACAAGTTTTTTCAAAACTGCCTTTAGCCCTTGACATGACTGGCTTGAAGCGTATTATTGGTTAATAAAGAAAACAATAAAAAAACCCACGTGAGAATTCCTAGTTTGGCGACCCGGAACACGTGAGTTAATCTTCAAAATTCGTATTTACTAGACTTAGTTTAAGACTTGATTTAGTAATCGTCAAGTCCTTACTTTTAGTAAATACATAAAAGATTAACTCTTCTCACGTGGCTAGTGAGAGGAGTTTTTAAT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CGGGARCGMSC

StartP-valueSite
4693.49e-07TGAGTATGAGCGGGAGCCCCCGCTCATGTTT
3509.38e-07GAACGACCAACGGGAGCGAGGATAAGGAGTT
3371.32e-06GTCAACGGTACCGGAACGACCAACGGGAGCG
3111.89e-06CAACTAAAAGCGGGTACGAGCTGGTAGTCAA
5273.27e-06GGGTTCGGGGCGACAGCGCCCGAGGGGTTGA

Motif GTTTTTWCDMCWBTKHNYTYADNCCTTGA

StartP-valueSite
6022.87e-13GAAACAACAAGTTTTTTCAAAACTGCCTTTAGCCCTTGACATGACTGGC
7402.33e-10TTCAAAATTCGTATTTACTAGACTTAGTTTAAGACTTGATTTAGTAATC
4152.97e-10GAAAGCCAAAGTTTCTTAAACTTTGCTTTCCTGCCCTCACGGCGAGTGA
2633.74e-10ACACTTTTTAGTTTGCACTCCTTCGAACTTAATCCTTGCACCACGTTGC
5558.57e-10TGAAACTGGCGTTTTTTTGCCAGTTTCCTCTTATCTTGATACATATAGA

Motif CACGTG

StartP-valueSite
8241.26e-04TAACTCTTCTCACGTGGCTAGTGAGA
7161.26e-04CGACCCGGAACACGTGAGTTAATCTT
6841.26e-04TAAAAAAACCCACGTGAGAATTCCTA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000067 100.0 851 0 0 1 851 1 851 0.0 1572
pORI00000082 91.356 590 44 6 263 848 752 1338 0.0 800
pORI00000250 84.858 317 36 12 540 849 1151 1462 0.0 309
pORI00000174 86.056 251 25 10 362 608 124 368 0.0 261