RefSeq NC_010079.1
Accession number NC_010079.1
DoriC accession number ORI92210360
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2872729..543 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.16e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.16e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.16e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.47e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAAG
6913.20e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACWKMT

StartP-valueSite
6683.48e-10GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6128.88e-09AAGCAAGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAAC
3931.02e-07ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAT
4741.22e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3081.62e-06ATGTTCGAACACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif CACSATGMG

StartP-valueSite
2333.95e-07GATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAA
2632.79e-06TTCATAACATCACCATGAGTTTGGTCCGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

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ORI96010074 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
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ORI92210347 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI92010319 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI90010305 98.904 730 8 0 1 730 259 988 0.0 1304
ORI10010066 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
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ORI10010017 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI96010198 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010084 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282
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ORI96010070 98.219 730 13 0 1 730 1 730 0.0 1277