RefSeq | NZ_CP021899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1919 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.2934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 54615..56533 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
ATGACCGCAGCATGGCGGTTTTATTTTCTTATGCCGTCAGGGCATGGAAGGCGACCACGCCGGAGTTAAACGGGCACCGGCCGCAAATCGCCGGAAACCGCAATGCTGAACGTATCGCCCGACCCAGCCCCCTCCCTGCAAAGCCCTAATCCCGCTCACCGCCACACAGCTGCCGTATGTCCCCCACGGGGGTGCGCAGTGGGCGCCGCGCGCCTGCGCGCGGGAACGGCGGCCCGCCTTCGGGTCGCGGCGCCGTACTGCGAGTTAGCGGCCGCACGCGGCCGGTTACGGGGGACACTACGCCATACGACCAGCGACCCGCTGAGCTGCACAATCCACGGATAACACAAGCTACATACATGTCGATATGGGAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTACCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCACCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGTGCCGGTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCCCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATTCGCCCATCTTCATGACAAAAATTTGTCAAATGACAGGCTCATGTGTGCTGATTTATG
ATGACCGCAGCATGGCGGTTTTATTTTCTTATGCCGTCAGGGCATGGAAGGCGACCACGCCGGAGTTAAACGGGCACCGGCCGCAAATCGCCGGAAACCGCAATGCTGAACGTATCGCCCGACCCAGCCCCCTCCCTGCAAAGCCCTAATCCCGCTCACCGCCACACAGCTGCCGTATGTCCCCCACGGGGGTGCGCAGTGGGCGCCGCGCGCCTGCGCGCGGGAACGGCGGCCCGCCTTCGGGTCGCGGCGCCGTACTGCGAGTTAGCGGCCGCACGCGGCCGGTTACGGGGGACACTACGCCATACGACCAGCGACCCGCTGAGCTGCACAATCCACGGATAACACAAGCTACATACATGTCGATATGGGAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTACCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCACCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGTGCCGGTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCCCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATCCGCCCACCCTTTCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGAGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATTCGCCCATCTTCATGACAAAAATTTGTCAAATGACAGGCTCATGTGTGCTGATTTATG
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif GCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAAT
Motif GCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCYGTGTGGRAAT
Motif GCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCYGTGTGGRAAT
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|