RefSeq | NC_021660 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1493 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.3369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 3981..5473 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
CACGCTGCCGCCCAGGCTTCCGGGTGCGAAACCGGAAGAGGGCTATACCGTTGCCGTGTGCTTGCCCACGGTTCGGGTCCTGTTTAGTACCAAATTCGATTTTGAAGAGTCTGAACTGGCTCATCACACAGGCGGCTAAACGGGCTTTACCTCTTTGATCTGAGAGCATTATAAACGGTACAGTGGCTTATTTAATACAGGTTTGATCATATGCCGCGTTAGACGTATAATTAACATGCCAAAAGAAGAATTTCACCTCGCTGTATGCCGGATGCCCGCGAAGCATCACAGGCTACAGAGCAGATAACCCGCCTTGAGCGGGTTTTCTGCTTTATGAGGCCGCCGCCAAGCGGTTTTTTTACGCCTCGTCAGGGCATTCGGTAAAACACCTATTCTCCTGAATCCCACTGGCCCCGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCGGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGCGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGCACGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCGGCAGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTACCGGGCGCCGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATTCGCCCATCTTCATGACAAAAATTTGTCAAATGACAGGCTCATGTGTGCTGATTTATG
CACGCTGCCGCCCAGGCTTCCGGGTGCGAAACCGGAAGAGGGCTATACCGTTGCCGTGTGCTTGCCCACGGTTCGGGTCCTGTTTAGTACCAAATTCGATTTTGAAGAGTCTGAACTGGCTCATCACACAGGCGGCTAAACGGGCTTTACCTCTTTGATCTGAGAGCATTATAAACGGTACAGTGGCTTATTTAATACAGGTTTGATCATATGCCGCGTTAGACGTATAATTAACATGCCAAAAGAAGAATTTCACCTCGCTGTATGCCGGATGCCCGCGAAGCATCACAGGCTACAGAGCAGATAACCCGCCTTGAGCGGGTTTTCTGCTTTATGAGGCCGCCGCCAAGCGGTTTTTTTACGCCTCGTCAGGGCATTCGGTAAAACACCTATTCTCCTGAATCCCACTGGCCCCGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCGGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGCGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGCACGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCGGCAGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTACCGGGCGCCGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATTCGCCCATCTTCATGACAAAAATTTGTCAAATGACAGGCTCATGTGTGCTGATTTATG
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif AATCSGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGYGTGGRAATCCGCCCAYCT
Motif TGCCGYGTGGRAATCCGCCCAYCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGRAA
Motif TGCCGGGCGCCGSTGCCGTGTGGGAATCSGCCCACCTTGCCGGGCGM
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|