| RefSeq | NC_021664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | pORI00000592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1123 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.3678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 3907..5029 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
CACGCTGCCGCCCAGGCTTCCGGGTGCGAAACCGGAAGAGGGCTATACCGTTGCCGTGTGCTTGCCCACGGTTCGGGTCCTGTTTAGTACCAAATTCGATTTTGAAGAGTCTGAACTGGCTCATCACACAGGCGGCTAAACGGGCTTTACCTCTTTGATCTGAGAGCATTATAAACGGTACAGTGGCTTATTTAATACAGGTTTGATCATATGCCGCGTTAGACGTATAATTAACATGCCAAAAGAAGAATTTCACCTCGCTGTATGCCGGATGCCCGCGAAGCATCACAGGCTACAGAGCAGATAACCCGCCTTGAGCGGGTTTTCTGCTTTATGAGGCCGCCGCCAAGCGGTTTTTTTACGCCTCGTCAGGGCATTCGGTAAAACACCTATTCTCCTGAATCCCACTGGCCCCGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCGGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGCGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGCACGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTAGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTCGTGTGGGAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATTCGCCCATCTTCATGACAAAAATTTGTCAAATGACAGGCTCATGTGTGCTGATTTATG
CACGCTGCCGCCCAGGCTTCCGGGTGCGAAACCGGAAGAGGGCTATACCGTTGCCGTGTGCTTGCCCACGGTTCGGGTCCTGTTTAGTACCAAATTCGATTTTGAAGAGTCTGAACTGGCTCATCACACAGGCGGCTAAACGGGCTTTACCTCTTTGATCTGAGAGCATTATAAACGGTACAGTGGCTTATTTAATACAGGTTTGATCATATGCCGCGTTAGACGTATAATTAACATGCCAAAAGAAGAATTTCACCTCGCTGTATGCCGGATGCCCGCGAAGCATCACAGGCTACAGAGCAGATAACCCGCCTTGAGCGGGTTTTCTGCTTTATGAGGCCGCCGCCAAGCGGTTTTTTTACGCCTCGTCAGGGCATTCGGTAAAACACCTATTCTCCTGAATCCCACTGGCCCCGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCGGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGCGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGCACGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTAGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTCGTGTGGGAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATTCGCCCATCTTCATGACAAAAATTTGTCAAATGACAGGCTCATGTGTGCTGATTTATG
AT-rich region
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| The information of repeat sequences |
Motif AATCSGCCCACCTTGCCGGGCGCCGSTGCCGTGTGGRAATCSGCCCACCT
Motif TGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGRAA
Motif CCAYCTTGCCGGGCGCSGCTGCCGYGTGG
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| The result of BLAST |
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