RefSeq | NC_021664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1123 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.3678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 3907..5029 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
CACGCTGCCGCCCAGGCTTCCGGGTGCGAAACCGGAAGAGGGCTATACCGTTGCCGTGTGCTTGCCCACGGTTCGGGTCCTGTTTAGTACCAAATTCGATTTTGAAGAGTCTGAACTGGCTCATCACACAGGCGGCTAAACGGGCTTTACCTCTTTGATCTGAGAGCATTATAAACGGTACAGTGGCTTATTTAATACAGGTTTGATCATATGCCGCGTTAGACGTATAATTAACATGCCAAAAGAAGAATTTCACCTCGCTGTATGCCGGATGCCCGCGAAGCATCACAGGCTACAGAGCAGATAACCCGCCTTGAGCGGGTTTTCTGCTTTATGAGGCCGCCGCCAAGCGGTTTTTTTACGCCTCGTCAGGGCATTCGGTAAAACACCTATTCTCCTGAATCCCACTGGCCCCGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCGGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGCGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGCACGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTAGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTCGTGTGGGAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATTCGCCCATCTTCATGACAAAAATTTGTCAAATGACAGGCTCATGTGTGCTGATTTATG
CACGCTGCCGCCCAGGCTTCCGGGTGCGAAACCGGAAGAGGGCTATACCGTTGCCGTGTGCTTGCCCACGGTTCGGGTCCTGTTTAGTACCAAATTCGATTTTGAAGAGTCTGAACTGGCTCATCACACAGGCGGCTAAACGGGCTTTACCTCTTTGATCTGAGAGCATTATAAACGGTACAGTGGCTTATTTAATACAGGTTTGATCATATGCCGCGTTAGACGTATAATTAACATGCCAAAAGAAGAATTTCACCTCGCTGTATGCCGGATGCCCGCGAAGCATCACAGGCTACAGAGCAGATAACCCGCCTTGAGCGGGTTTTCTGCTTTATGAGGCCGCCGCCAAGCGGTTTTTTTACGCCTCGTCAGGGCATTCGGTAAAACACCTATTCTCCTGAATCCCACTGGCCCCGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCGGCTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGCGCGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGCACGCCGGTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGCGTGGGAATCGGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGAGGCTGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGCGTGAGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTAGTGTGGAAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGCTGTCGTGTGGGAATCCGCCCATCTTGCCGGGCGCCGGTGCTGTGTGGAAATTCGCCCATCTTCATGACAAAAATTTGTCAAATGACAGGCTCATGTGTGCTGATTTATG
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif AATCSGCCCACCTTGCCGGGCGCCGSTGCCGTGTGGRAATCSGCCCACCT
Motif TGCCGTGTGGGAATCCGCCCACCTTGCCGGGCGCCGCTGCCGTGTGGRAA
Motif CCAYCTTGCCGGGCGCSGCTGCCGYGTGG
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The result of BLAST |
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