| RefSeq | NC_019087 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | pORI00000547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1262 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.3399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 724..1985 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGAATTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGACGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGCTTTCCACACGGCACCGGCGCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCACACAAGCAACGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAAGCAACGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGGATTTCATAAACTTTAATTATACCTTTGTGTTATTTGTGGATTGTGCAGCTCAGTGGGGCGCTGGCCGTGACGGTGCGGTGTCCCCCGTAACCGGCCGCGCGGCGGCCGCTAACTCGCAGTACGGCGCCGCGACCCGCAGGCGGGCCGCCGTACCCGCGCGCAGGCGCGCGGCGCCCACTGCGCACCCCCGTGGGGGACGTGCGGCAGCTACGTGACGGCGGGCTGGGTTATGGCTTAGCAGGGAGGGGGATTGGCCTGTTGCTCCGGTCAGTCCCGCAGTTTCCGGCGATTTGCGGCCGGTGTCCGGTGGAGTCCGGCGCGGTCGCCTTCCATGCCCTGACGGGCATAAAAACAGGTAAATAAATTCCGTACTTGTATTGACTTTTAAGGCATAATCACCGATAATTAAATCATCGGGAGGCAATACCGCCACCCGAAAAATGGGCATATGGCGGCACATCGCATTCGACGAAACCCAACCTAACCGGAGTCATCAGGCTAGAATG
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGAATTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGACGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGCTTTCCACACGGCACCGGCGCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCACACAAGCAACGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAAGCAACGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGGATTTCATAAACTTTAATTATACCTTTGTGTTATTTGTGGATTGTGCAGCTCAGTGGGGCGCTGGCCGTGACGGTGCGGTGTCCCCCGTAACCGGCCGCGCGGCGGCCGCTAACTCGCAGTACGGCGCCGCGACCCGCAGGCGGGCCGCCGTACCCGCGCGCAGGCGCGCGGCGCCCACTGCGCACCCCCGTGGGGGACGTGCGGCAGCTACGTGACGGCGGGCTGGGTTATGGCTTAGCAGGGAGGGGGATTGGCCTGTTGCTCCGGTCAGTCCCGCAGTTTCCGGCGATTTGCGGCCGGTGTCCGGTGGAGTCCGGCGCGGTCGCCTTCCATGCCCTGACGGGCATAAAAACAGGTAAATAAATTCCGTACTTGTATTGACTTTTAAGGCATAATCACCGATAATTAAATCATCGGGAGGCAATACCGCCACCCGAAAAATGGGCATATGGCGGCACATCGCATTCGACGAAACCCAACCTAACCGGAGTCATCAGGCTAGAATG
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif CGGATTYCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTYCCACAC
Motif CCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACRGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGG
Motif ATTYCCACACRGCACCGGCGC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|