RefSeq | NC_009980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1943 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.2928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 61531..1902 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGAATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGACGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACTGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCATAACTTTAATTATACCTTTGTGTTATTTGTGGATTGTGCAGCTCAGTGGGGCGCTGGCCGTGACGGTGCGGTGTCCCCCGTAACCGCCCGCGCGGCGGCCGCTAACTCGCAGTACGGCGCCGCGACCCGCAGGCGGGCCGCCGTACCCGCGCGCAGGCGCGCGGCGCCCACTGCGCACCCCCGTGGAGGACGTGCGGCAGCTGCGTGGCGGCGGGCTGGGTTATGGCTTAGCAGGGAGGGGGGTTGGCCTGTTGCTCCGGTCAGTCCCGCAGTTTCCGGCGATTTGCGGCCGGTGTCCGGTGGAGTCCGGCGCGGTCGCCTTCCATGCCCTGACGGGCATATGGCGGCACATCGCATTCGACGAAACCCAACCTAACCGGAGTCATCAGGCTAGAATG
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGAATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGACGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACTGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCATAACTTTAATTATACCTTTGTGTTATTTGTGGATTGTGCAGCTCAGTGGGGCGCTGGCCGTGACGGTGCGGTGTCCCCCGTAACCGCCCGCGCGGCGGCCGCTAACTCGCAGTACGGCGCCGCGACCCGCAGGCGGGCCGCCGTACCCGCGCGCAGGCGCGCGGCGCCCACTGCGCACCCCCGTGGAGGACGTGCGGCAGCTGCGTGGCGGCGGGCTGGGTTATGGCTTAGCAGGGAGGGGGGTTGGCCTGTTGCTCCGGTCAGTCCCGCAGTTTCCGGCGATTTGCGGCCGGTGTCCGGTGGAGTCCGGCGCGGTCGCCTTCCATGCCCTGACGGGCATATGGCGGCACATCGCATTCGACGAAACCCAACCTAACCGGAGTCATCAGGCTAGAATG
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif ATTYCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTYCCACACGGC
Motif GYGGATTYCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGYGGATTYCCACA
Motif ATTCCCACACRGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGYGGATTYCCACACRGC
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The result of BLAST |
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