| RefSeq | NC_009980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | pORI00000418 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1943 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.2928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 61531..1902 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGAATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGACGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACTGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCATAACTTTAATTATACCTTTGTGTTATTTGTGGATTGTGCAGCTCAGTGGGGCGCTGGCCGTGACGGTGCGGTGTCCCCCGTAACCGCCCGCGCGGCGGCCGCTAACTCGCAGTACGGCGCCGCGACCCGCAGGCGGGCCGCCGTACCCGCGCGCAGGCGCGCGGCGCCCACTGCGCACCCCCGTGGAGGACGTGCGGCAGCTGCGTGGCGGCGGGCTGGGTTATGGCTTAGCAGGGAGGGGGGTTGGCCTGTTGCTCCGGTCAGTCCCGCAGTTTCCGGCGATTTGCGGCCGGTGTCCGGTGGAGTCCGGCGCGGTCGCCTTCCATGCCCTGACGGGCATATGGCGGCACATCGCATTCGACGAAACCCAACCTAACCGGAGTCATCAGGCTAGAATG
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGAATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGACGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACTGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACAGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGTGGATTTCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCATAACTTTAATTATACCTTTGTGTTATTTGTGGATTGTGCAGCTCAGTGGGGCGCTGGCCGTGACGGTGCGGTGTCCCCCGTAACCGCCCGCGCGGCGGCCGCTAACTCGCAGTACGGCGCCGCGACCCGCAGGCGGGCCGCCGTACCCGCGCGCAGGCGCGCGGCGCCCACTGCGCACCCCCGTGGAGGACGTGCGGCAGCTGCGTGGCGGCGGGCTGGGTTATGGCTTAGCAGGGAGGGGGGTTGGCCTGTTGCTCCGGTCAGTCCCGCAGTTTCCGGCGATTTGCGGCCGGTGTCCGGTGGAGTCCGGCGCGGTCGCCTTCCATGCCCTGACGGGCATATGGCGGCACATCGCATTCGACGAAACCCAACCTAACCGGAGTCATCAGGCTAGAATG
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif ATTYCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTYCCACACGGC
Motif GYGGATTYCCACACGGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGYGGATTYCCACA
Motif ATTCCCACACRGCACCGGCGCCCGGCAAGGTGGGYGGATTYCCACACRGC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|