| RefSeq | NC_032101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | pORI00000628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 2108 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.3748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 721..2828 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACTACAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCTCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCTCACGCGGCAGCGGCGCCTGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTAGGCCGATTCCCGCGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCGCGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGACGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGACGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCGGGGCCAGTGGGATTCAGGAGAATAGGTGTTTTACCGAATGCCCTGACGAGGCGTAAAAAAACCGCTTGGCGGCGGCCTCATAAAGCAGAAAACCCGCTCAAGGCGGGTTATCTGCTCTGTAGCCTGTGATGCTTCGCGGGCATCCGGCATACAGCGAGGTGAAATTCTTCTTTTGGCATGTTAATTATACGTCTAACGTGGCATATGATCAAACCTGTATTAAATAAGCCACTGTACCGTTTATAATGCTCTGAGATCAAAGAGGTAAAGCCCGTTTAGCCGCCTGTGTGATGAGCCAGTTCAGACTCTTCAAAATCGAATTTGGTACTAAACAGGACCCGAACCGTGGGCAAGCACACGGCAACGGTATAGCCCTCTTCCGGTTTCGCACCCGGAAGCCTGGGCGGCAGCGTGGTGAAATTCTTCTTTTGGTTAAGTGAATGGCATAACCGGATGGGCGGATTAGAGGAAAGGGGATTGCCTAGTAACCTACGCGCCACAGAGATGGAGGTGCGGGGAATGATTGAGCTGATTATCGCTATTCTGACCTTAATTGCGGCTGTATTGCAGTTGATCAACTGGTTCCTTTAATGGTGCCGGAGTCTGTGAAGGTGAAAGCCTGAACGGGCAAAACTGAAAGGTTTATAGCCGTCCTTCGGGGCGGCTTTTTTTCGGCAAAATTAGGGTTTTACCGAATAATGCAGAGTTTTAAGGTGAGAATTTGCAGACTTGGCGTTTTACCGAACATAGATACTCCCTAGGCTGATAGGTCCATTAGTTATCACCCTACCTGAACACATTGTAAAAGATGTCAGTCTCCAGTGACTTGTGTACTATCAACTGACAAGACTCTTACACGCAACGCAGGGGAATGGAGTTTT
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACTACAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCTCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCTCACGCGGCAGCGGCGCCTGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTAGGCCGATTCCCGCGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCGCGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGACGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGACGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCGGGGCCAGTGGGATTCAGGAGAATAGGTGTTTTACCGAATGCCCTGACGAGGCGTAAAAAAACCGCTTGGCGGCGGCCTCATAAAGCAGAAAACCCGCTCAAGGCGGGTTATCTGCTCTGTAGCCTGTGATGCTTCGCGGGCATCCGGCATACAGCGAGGTGAAATTCTTCTTTTGGCATGTTAATTATACGTCTAACGTGGCATATGATCAAACCTGTATTAAATAAGCCACTGTACCGTTTATAATGCTCTGAGATCAAAGAGGTAAAGCCCGTTTAGCCGCCTGTGTGATGAGCCAGTTCAGACTCTTCAAAATCGAATTTGGTACTAAACAGGACCCGAACCGTGGGCAAGCACACGGCAACGGTATAGCCCTCTTCCGGTTTCGCACCCGGAAGCCTGGGCGGCAGCGTGGTGAAATTCTTCTTTTGGTTAAGTGAATGGCATAACCGGATGGGCGGATTAGAGGAAAGGGGATTGCCTAGTAACCTACGCGCCACAGAGATGGAGGTGCGGGGAATGATTGAGCTGATTATCGCTATTCTGACCTTAATTGCGGCTGTATTGCAGTTGATCAACTGGTTCCTTTAATGGTGCCGGAGTCTGTGAAGGTGAAAGCCTGAACGGGCAAAACTGAAAGGTTTATAGCCGTCCTTCGGGGCGGCTTTTTTTCGGCAAAATTAGGGTTTTACCGAATAATGCAGAGTTTTAAGGTGAGAATTTGCAGACTTGGCGTTTTACCGAACATAGATACTCCCTAGGCTGATAGGTCCATTAGTTATCACCCTACCTGAACACATTGTAAAAGATGTCAGTCTCCAGTGACTTGTGTACTATCAACTGACAAGACTCTTACACGCAACGCAGGGGAATGGAGTTTT
AT-rich region
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| The information of repeat sequences |
Motif CSGATTCCCACRCGGCASCSKCGCSCGGCAAGGTGGGCSGATTCCCACAC
Motif CSGATTCCCRCRCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCSGATTCCCACAC
Motif TGGGCGGATTYCCACRCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGDTGGGCGGATT
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| The result of BLAST |
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