RefSeq | NC_032101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 2108 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.3748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 721..2828 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACTACAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCTCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCTCACGCGGCAGCGGCGCCTGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTAGGCCGATTCCCGCGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCGCGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGACGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGACGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCGGGGCCAGTGGGATTCAGGAGAATAGGTGTTTTACCGAATGCCCTGACGAGGCGTAAAAAAACCGCTTGGCGGCGGCCTCATAAAGCAGAAAACCCGCTCAAGGCGGGTTATCTGCTCTGTAGCCTGTGATGCTTCGCGGGCATCCGGCATACAGCGAGGTGAAATTCTTCTTTTGGCATGTTAATTATACGTCTAACGTGGCATATGATCAAACCTGTATTAAATAAGCCACTGTACCGTTTATAATGCTCTGAGATCAAAGAGGTAAAGCCCGTTTAGCCGCCTGTGTGATGAGCCAGTTCAGACTCTTCAAAATCGAATTTGGTACTAAACAGGACCCGAACCGTGGGCAAGCACACGGCAACGGTATAGCCCTCTTCCGGTTTCGCACCCGGAAGCCTGGGCGGCAGCGTGGTGAAATTCTTCTTTTGGTTAAGTGAATGGCATAACCGGATGGGCGGATTAGAGGAAAGGGGATTGCCTAGTAACCTACGCGCCACAGAGATGGAGGTGCGGGGAATGATTGAGCTGATTATCGCTATTCTGACCTTAATTGCGGCTGTATTGCAGTTGATCAACTGGTTCCTTTAATGGTGCCGGAGTCTGTGAAGGTGAAAGCCTGAACGGGCAAAACTGAAAGGTTTATAGCCGTCCTTCGGGGCGGCTTTTTTTCGGCAAAATTAGGGTTTTACCGAATAATGCAGAGTTTTAAGGTGAGAATTTGCAGACTTGGCGTTTTACCGAACATAGATACTCCCTAGGCTGATAGGTCCATTAGTTATCACCCTACCTGAACACATTGTAAAAGATGTCAGTCTCCAGTGACTTGTGTACTATCAACTGACAAGACTCTTACACGCAACGCAGGGGAATGGAGTTTT
CATAAATCAGCACACATGAGCCTGTCATTTGACAAATTTTTGTCATGAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACTACAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGATGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCTCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCTCACGCGGCAGCGGCGCCTGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTAGGCCGATTCCCGCGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACGCGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCCTCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCACCGGCGCGCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCCGATTCCCGCGCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTCCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGACGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGACGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCGGATTTCCACACGGCAGCGGCGCGGGGCCAGTGGGATTCAGGAGAATAGGTGTTTTACCGAATGCCCTGACGAGGCGTAAAAAAACCGCTTGGCGGCGGCCTCATAAAGCAGAAAACCCGCTCAAGGCGGGTTATCTGCTCTGTAGCCTGTGATGCTTCGCGGGCATCCGGCATACAGCGAGGTGAAATTCTTCTTTTGGCATGTTAATTATACGTCTAACGTGGCATATGATCAAACCTGTATTAAATAAGCCACTGTACCGTTTATAATGCTCTGAGATCAAAGAGGTAAAGCCCGTTTAGCCGCCTGTGTGATGAGCCAGTTCAGACTCTTCAAAATCGAATTTGGTACTAAACAGGACCCGAACCGTGGGCAAGCACACGGCAACGGTATAGCCCTCTTCCGGTTTCGCACCCGGAAGCCTGGGCGGCAGCGTGGTGAAATTCTTCTTTTGGTTAAGTGAATGGCATAACCGGATGGGCGGATTAGAGGAAAGGGGATTGCCTAGTAACCTACGCGCCACAGAGATGGAGGTGCGGGGAATGATTGAGCTGATTATCGCTATTCTGACCTTAATTGCGGCTGTATTGCAGTTGATCAACTGGTTCCTTTAATGGTGCCGGAGTCTGTGAAGGTGAAAGCCTGAACGGGCAAAACTGAAAGGTTTATAGCCGTCCTTCGGGGCGGCTTTTTTTCGGCAAAATTAGGGTTTTACCGAATAATGCAGAGTTTTAAGGTGAGAATTTGCAGACTTGGCGTTTTACCGAACATAGATACTCCCTAGGCTGATAGGTCCATTAGTTATCACCCTACCTGAACACATTGTAAAAGATGTCAGTCTCCAGTGACTTGTGTACTATCAACTGACAAGACTCTTACACGCAACGCAGGGGAATGGAGTTTT
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif CSGATTCCCACRCGGCASCSKCGCSCGGCAAGGTGGGCSGATTCCCACAC
Motif CSGATTCCCRCRCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGGTGGGCSGATTCCCACAC
Motif TGGGCGGATTYCCACRCGGCAGCGGCGCCCGGCAAGDTGGGCGGATT
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The result of BLAST |
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