RefSeq NC_025008
DoriC accession number pORI00000300
OriC length 4201 nt
OriC AT content 0.6329
The location of oriC region 4870..9070 nt
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OriC map
OriC sequences
GAAAAGGCACTCGAATGAGTGCCTTTTGTGCGTTTTGAGCGTAGCGAAAAAACGGTTCTTTCTTATCTTGATACATATAGAAATAACGTCATTTTTATTTTAGTTGCTGAAAGGTGCGTTGAAGTGTTGGTATGTATGTGTTTTAAAGTATTGAAAACCCTTAAAATTGGTTGCACAGAAAAACCCCATCTGTTAAAGTTATAAGTGACCAAACAAATAACTAAATAGATGGGGGTTTCTTTTAATATTATGTGTCCTAATAGTAGCATTTATTCAGATGAAAAATCAAGGGTTTTAGTGGACAAGACAAAAAGTGGAAAAGTGAGACCATGGAGAGAAAAGAAAATCGCTAATGTTGATTACTTTGAACTTCTGCATATTCTTGAATTTAAAAAGGCTGAAAGAGTAAAAGATTGTGCTGAAATATTAGAGTATAAACAAAATCGTGAAACAGGCGAAAGAAAGTTGTATCGAGTGTTTGAGTCAAGTATTTATAGGCAGTTTTTTTAACACCTTAAATTTGAAAGCGGATTCAAACCTTAGGATACTCTCTTGGTAAGAATTTTGCCTTTTTTAAAAGCCAGACAACTCTTTTAATGCTTTGTAAACTGGTATGTTAGCTTTTCCTTTTAGATATAGAACATTGTCTCTAGTGGCTTCACCAATTGTGCTCGTAACTTTTTCTTTATAGTATCTTGGGGGGTTCTTTTCCACCTTTGTTTCAGTCCATTTTTCGATCCTGCCAAATAGTGTTTTTAAGGTCAATTTATCCAAGTAAGCTACCAAACCAGTGAACATGGCACTTACACCTTTATCCACCCAACTACGGCCATTTTTAAGTCTTTTGGCAAATACACTCATGGTTCCTTCTGCACTACCCATCGGACGCATTCCTGTTGTATCTATACCCTGTTCTTTAAGCCAGTTACGATAATCTCCCAAGGCTTCTGGATATTTCTCTAATTGGCGAATAAATGCTTCTAGACGTTCCTCTTGCTCATCATCCTCTAGCGTTCCGACTGCACTGTTAAGCTCTGTAAGCAATTTCTCATAATCATATGATGCAAGCGCCTTACGAATTGGACGATAACGTGGGTGATGACGGAACAAACTTCGAATCTCCCGTGCCACATGGAAACGATCAAGCGAAAAGAATGCACGATCTTTGAAATAGTCACGACAAGTTGTAATCCAATTTGCACCATCTCCATTTATTACCAACTTATGAATGGTTGGATCATACTCAAAGTTTTCAATGAGAAAGTCCTCAAACGCCTCCCAAAATGGCTGGTTCCCTTCATGTACGAAATGGCGTTTATTCTTCAGTCTTACTCGTTTCCCATTGACTTCCCAGCCTTGATGAACTGCGGCTATTTTCTCTTCTTTTCCCTTTTTTCGTTTACCTTGACGTTTTACAAACAAACCATCGACCTCTACAAATAATACAGGTTGATGTACATGCTCACGCTTTTTTGGAATACTCGAAACTTGTAATAAGTGTTGACGGATTGCCTCATGACTAATAACCCGATAGCCTAAAAGGGTTTCTAACGTACTGGCTGCTTTTCGATAGGAAGGTCCCTGAACAGCTAATTCAATAGCTACCTCCTCAATCAATGGGCTAAAAGAACCTGCATCCTCAAACTCTAAATAACGATCAAGGAGAAAAACATATTCCCCTGTCTCCCGGTCACGGTAATAATTACGATTTAATTCAATCTCTCCGAAGAGACTAGTTATATGATATTTTCTTTTATCAATGAGTCGATAGCGTTTTTTATCTCGTTCTTCTGCAATCTGTTGATCCATATCCTCCAAAATATTTTTCATAACGCTGGAGAAGGTATCTTGTAATTGCCTCCAAACCATTTGCTCAATTTCTTTTAAATTTGGATATACTGTGTTATTCTTTTGCATGAGGGGTTACTCCTTTGTTTGTGATTTAGTTTTGGTTGACTAAGATTCTACCAAGGAGTAACCCTCTTTTTCATGTTATTTGCTTATTAACTACCGCGCTTTCGCTTGCTTGCCCTTCATTTAGTGAACTCACTACGTTCGTTCACTAAATGAAGGGGATAAAATTTATTCCGCCCACAATAATTTTACTCATACAGTGGACAAGACAAAAAGTGGAAAAGTGAGACCATGGAGAGAAAAGAAAATCGCTAATGTTGATTACTTTGAACTTCTGCATATTCTTGAATTTAAAAAGGCTGAAAGAGTAAAAGATTGTGCTGAAATATTAGAGTATAAACAAAATCGTGAAACAGGCGAAAGAAAGTTGTATCGAGTGTGGTTTTGTAAATCCAGGCTTTGTCCAATGTGCAACTGGAGGAGAGCAATGAAACATGGCATTCAGTCACAAAAGGTTGTTGCTGAAGTTATTAAACAAAAGCCAACAGTTCGTTGGTTGTTTCTCACATTAACAGTTAAAAATGTTTATGATGGCGAAGAATTAAATAAGAGTTTGTCAGATATGGCTCAAGGATTTCGCCGAATGATGCAATATAAAAAAATTAATAAAAATCTTGTTGGTTTTATGCGTGCAACGGAAGTGACAATAAATAATAAAGATAATTCTTATAATCAGCACATGCATGTATTGGTATGTGTGGAACCAACTTATTTTAAGAATACAGAAAACTACGTGAATCAAAAACAATGGATTCAATTTTGGAAAAAGGCAATGAAATTAGACTATGATCCAAATGTAAAAGTTCAAATGATTCGACCGAAAAATAAATATAAATCGGATATACAATCGGCAATTGACGAAACTGCAAAATATCCTGTAAAGGATACGGATTTTATGACCGATGATGAAGAAAAGAATTTGAAACGTTTGTCTGATTTGGAGGAAGGTTTACACCGTAAAAGGTTAATCTCCTATGGTGGTTTGTTAAAAGAAATACATAAAAAATTAAACCTTGATGACACAGAAGAAGGCGATTTGATTCATACAGATGATGACGAAAAAGCCGATGAAGATGGATTTTCTATTATTGCAATGTGGAATTGGGAACGGAAAAATTATTTTATTAAAGAGTAGTTCAACAAACGGGCCAGTTTGTTGAAGATTAGATGCTATAATTGTTATTAAAAGGATTGAAGGATGCTTAGGAAGACGAGTTATTAATAGCTGAATAAGAACGGTGCTCTCCAAATATTCTTATTTAGAAAAGCAAATCTAAAATTATCTGAAAAGGGAATGAGAATAGTGAATGGACCAATAATAATGACTAGAGAAGAAAGAATGAAGATTGTTCATGAAATTAAGGAACGAATATTGGATAAATATGGGGATGATGTTAAGGCTATTGGTGTTTATGGCTCTCTTGGTCGTCAGACTGATGGGCCCTATTCGGATATTGAGATGATGTGTGTCATGTCAACAGAGGAAGCAGAGTTCAGCCATGAATGGACAACCGGTGAGTGGAAGGTGGAAGTGAATTTTGATAGCGAAGAGATTCTACTAGATTATGCATCTCAGGTGGAATCAGATTGGCCGCTTACACATGGTCAATTTTTCTCTATTTTGCCGATTTATGATTCAGGTGGATACTTAGAGAAAGTGTATCAAACTGCTAAATCGGTAGAAGCCCAAAAGTTCCACGATGCGATTTGTGCCCTTATCGTAGAAGAGCTGTTTGAATATGCAGGCAAATGGCGTAATATTCGTGTGCAAGGACCGACAACATTTCTACCATCCTTGACTGTACAGGTAGCAATGGCAGGTGCCATGTTGATTGGTCTGCATCATCGCATCTGTTATACGACGAGCGCTTCGGTCTTAACTGAAGCAGTTAAGCAATCAGATCTTCCTTCAGGTTATGACCATCTGTGCCAGTTCGTAATGTCTGGTCAACTTTCCGACTCTGAGAAACTTCTGGAATCGCTAGAGAATTTCTGGAATGGGATTCAGGAGTGGACAGAACGACACGGATATATAGTGGATGTGTCAAAACGCATACCATTTTGAACGATGACCTCTAATAATTGTTAATCATGTTGGTTACGTATTTATTAACTTCTCCTAGTATTAGTAATTATCATGGCTGTCATGGCGCATTAACGGAATAAAGGGTGTGCTTAAATCGGGCCATTTTGCGTAATAAGAAAAAGGATTAATTATGAGCGAATTGAATTAATAATAAGGTAATAGATTTACATTAGAAAATGAAAGGGGATTTTATGCGTGAGA
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AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif AYWAGASWAWAARYRRAAWMGTGARACMRKSGARAGAAARKWRWATCGM

StartP-valueSite
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3022.90e-23GTTTTAGTGGACAAGACAAAAAGTGGAAAAGTGAGACCATGGAGAGAAAAGAAAATCGCTAATGTTGAT
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4262.75e-22GTGCTGAAATATTAGAGTATAAACAAAATCGTGAAACAGGCGAAAGAAAGTTGTATCGAGTGTTTGAGT

Motif CTGCATMYTCWWRMWYTWAAWAASGMTSAARGAGWAAAASATWKTSC

StartP-valueSite
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Motif RACGCMTTCCNDHWTGRHYGATAMCCT

StartP-valueSite
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The result of BLAST Download

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