RefSeq NC_019232
DoriC accession number pORI00000108
OriC length 1312 nt
OriC AT content 0.6463
The location of oriC region 2448..779 nt
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OriC map
OriC sequences
AATAATCACTCCTTTCTATATTCTCACTTCAATTGTTATTATAGTCCAAAAAAGTCAGTTTTCAAGTATTATGTCTTTGAAATTGTAAAATCGTGCTACGGGCGTTTTATAGGGGTTTAACAACGTCACTATTTTAGTTCGTCCAACTGTTGGACAATTAGGACGTTTTATACCGACATTTTCTAACAAATTCAATTGTTCGCAAAACGAACAAACAAACCTTGTTCTTTCTAGTACACTAAATTTAATTGTTCCTAAATTGTGCGACGTGGTAGAATTTGGAAGCTCTTAAATGTCGTAACGTTTCGACATTTGGAAGCTCCTAAATGTTGTAACGTTGCAATTTATTTTAGATTTGAGTCTAAAACGCTCGGGCGTATTGATATATGTAGGGTGTAAAATTTTCCCCGACCCAGCAAGAAAGAAAGTCAAAGACTACGTTATCAAGTTGGAAAATGTCCAACCAAATTGGAAAAATTCCAACCAGTTTCCAACCAGTGTCCAACAGAGATAGAGTTAGAATTAGAGTTAAATCTAGAAAATCAGCGAAAGGTTACTTGCTGACAAGAGGAAATTGGAATAAAAAGCCTTAATTTTTGAGTGATGTCATTTCTTCCATGTCATATCTCTTTCATATGCCCCTAATTCTCAAATTTCGGGGGTTATTTGCCGTTTTACCGTCTCTCTAGTAAATGTACCGCTAGATTATTTAGGACGGTTACAAGCGATTTTAGAGCCATTTCTTGCCCTTTTGGATAAAGTAAGCTCTGACTTGCTTTCCTTTATCGGTACGCTGTATCATAGCAATTTATTTTGCTATGTTCAGCTTTATGATGTGGTCGGTCATATCTTGCAGATCTCCAAGGGTGGTACATTTTTGGGTCATCCTTAAATAGTCCTCGTTTTTGGCAAAACCATATAGCTAGATGTTCGAACCTGCTCAAATTTGAGCGTATTGAAATCTTGATTTTGCTGTGTAGTTGTAACTACGGAGCCATATTTCTCGTTGTTCTCTCGTGCTTCTTTGGTGAATTTTTCCTGAAAGTAAAAAGAGGGCTGAAAGCCCAAAAAAAGCAGTCGAAAGACTGCTTTCTTCTTATCTTGATACTAGTAGGAAATAACTCTCACGCAAAAATCATATCACCATGACCTTGTAAACCCTTGATACTACTGGATTTTTAGGCAAAAAAAAAGCTCCTTTACGGTATAAAGCTTTCGTGTTATAATTTAAGGTGCTTAATCAAAAATTATGAAAGGATAACGTAAGGAGTTTTTTTTATTTCTTTGTTATTATAACAGGTAAGATTATATC
AATAATCACTCCTTTCTATATTCTCACTTCAATTGTTATTATAGTCCAAAAAAGTCAGTTTTCAAGTATTATGTCTTTGAAATTGTAAAATCGTGCTACGGGCGTTTTATAGGGGTTTAACAACGTCACTATTTTAGTTCGTCCAACTGTTGGACAATTAGGACGTTTTATACCGACATTTTCTAACAAATTCAATTGTTCGCAAAACGAACAAACAAACCTTGTTCTTTCTAGTACACTAAATTTAATTGTTCCTAAATTGTGCGACGTGGTAGAATTTGGAAGCTCTTAAATGTCGTAACGTTTCGACATTTGGAAGCTCCTAAATGTTGTAACGTTGCAATTTATTTTAGATTTGAGTCTAAAACGCTCGGGCGTATTGATATATGTAGGGTGTAAAATTTTCCCCGACCCAGCAAGAAAGAAAGTCAAAGACTACGTTATCAAGTTGGAAAATGTCCAACCAAATTGGAAAAATTCCAACCAGTTTCCAACCAGTGTCCAACAGAGATAGAGTTAGAATTAGAGTTAAATCTAGAAAATCAGCGAAAGGTTACTTGCTGACAAGAGGAAATTGGAATAAAAAGCCTTAATTTTTGAGTGATGTCATTTCTTCCATGTCATATCTCTTTCATATGCCCCTAATTCTCAAATTTCGGGGGTTATTTGCCGTTTTACCGTCTCTCTAGTAAATGTACCGCTAGATTATTTAGGACGGTTACAAGCGATTTTAGAGCCATTTCTTGCCCTTTTGGATAAAGTAAGCTCTGACTTGCTTTCCTTTATCGGTACGCTGTATCATAGCAATTTATTTTGCTATGTTCAGCTTTATGATGTGGTCGGTCATATCTTGCAGATCTCCAAGGGTGGTACATTTTTGGGTCATCCTTAAATAGTCCTCGTTTTTGGCAAAACCATATAGCTAGATGTTCGAACCTGCTCAAATTTGAGCGTATTGAAATCTTGATTTTGCTGTGTAGTTGTAACTACGGAGCCATATTTCTCGTTGTTCTCTCGTGCTTCTTTGGTGAATTTTTCCTGAAAGTAAAAAGAGGGCTGAAAGCCCAAAAAAAGCAGTCGAAAGACTGCTTTCTTCTTATCTTGATACTAGTAGGAAATAACTCTCACGCAAAAATCATATCACCATGACCTTGTAAACCCTTGATACTACTGGATTTTTAGGCAAAAAAAAAGCTCCTTTACGGTATAAAGCTTTCGTGTTATAATTTAAGGTGCTTAATCAAAAATTATGAAAGGATAACGTAAGGAGTTTTTTTTATTTCTTTGTTATTATAACAGGTAAGATTATATC
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif ATTTDGAAGHTCYTAAATGKTGBDACGTK

StartP-valueSite
3114.30e-15ACGTTTCGACATTTGGAAGCTCCTAAATGTTGTAACGTTGCAATTTATT
2774.20e-14ACGTGGTAGAATTTGGAAGCTCTTAAATGTCGTAACGTTTCGACATTTG
8484.45e-11GGTCGGTCATATCTTGCAGATCTCCAAGGGTGGTACATTTTTGGGTCAT
2434.45e-11AGTACACTAAATTTAATTGTTCCTAAATTGTGCGACGTGGTAGAATTTG
741.29e-10AAGTATTATGTCTTTGAAATTGTAAAATCGTGCTACGGGCGTTTTATAG

Motif GTCCAAMAAARDYAG

StartP-valueSite
445.05e-09TGTTATTATAGTCCAAAAAAGTCAGTTTTCAAGTA
10633.07e-08AGGGCTGAAAGCCCAAAAAAAGCAGTCGAAAGACT
5006.28e-08TCCAACCAGTGTCCAACAGAGATAGAGTTAGAATT
4581.03e-07GTTGGAAAATGTCCAACCAAATTGGAAAAATTCCA

Motif CSAACCAG

StartP-valueSite
4918.97e-06CAACCAGTTTCCAACCAGTGTCCAACAG
4808.97e-06TGGAAAAATTCCAACCAGTTTCCAACCA
4091.42e-05AAATTTTCCCCGACCCAGCAAGAAAGAA
9322.46e-05GCTAGATGTTCGAACCTGCTCAAATTTG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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