RefSeq NC_005098
DoriC accession number pORI00000010
OriC length 924 nt
OriC AT content 0.6797
The location of oriC region 2301..313 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
TTTACCAACTGTTTTATAATTAGGGCGTTTTATACCAACATTTTCCAACAATTAGGGCGTCTTTCTTTTTAATTAGTGATTCTGTGGTCATATAACTTCTTTCTGTTAATCAGTTAAATTAACGGTTAATAATACCGTTGACCGCCAAAACCCTTTATATATCAATGGTTTCAGCCACTTTGGTTAATGAGTTAAGCTAATTTTTAAAGTCGCTCTCTCTATATATATTATTTATTTATTTATTTTTAACTTTATATAAAAAGTATTAACTCATTAACTAAAGCAACCAAACCCTTATGTATCAAGTGGTTTGACGGTTAATGATTGCATTAACTTTAGATTAACTAAGTAACCATAATTACTACACAGGTCACCTCATACTACCATAGACACTACTATTAGTGTCAAAGATGTGTCACAGTGTCCTAACAAGAAGTACAGTCGTTTTATGCCGTGAAAGTTATTTGACAATAAGCTAGGTCAAGTTAGACTGGTTTAGGCGTGTCAGTCTGAATTTTGTTCAGCTGACCGACAAACCAAAGACTAACGACCTAGGTTTATTGTTGTCAAATAAACCATGGAATAAATAGACTTAAGTTTGAATGTTGTTTGATTTAGATGCTAGCGTTTTGAGAGTGAATTATTGCTGAAAATAAAAAGAGGGCTGAAAGCCCAAAAAAAGCAGTCGCAAGACTGCTTTCTTCTTATCTTGATACTAGTAGAATTAACTCTCACGCAAAAAACATACCATTATATCAGTGTAAACCCTTGATATTACTGGTTTTTTGGGCAAAAAAAAAACCGTTTCATTTCTGAAAGGTTTCGTGTTATAATTTTATGTGTCGAAGGGGAAAAATATAAATACACGAAAGGAGAAATACGGATTTTTTTGCATCGCAAATTAATTTGTATATATAGTATAGC
TTTACCAACTGTTTTATAATTAGGGCGTTTTATACCAACATTTTCCAACAATTAGGGCGTCTTTCTTTTTAATTAGTGATTCTGTGGTCATATAACTTCTTTCTGTTAATCAGTTAAATTAACGGTTAATAATACCGTTGACCGCCAAAACCCTTTATATATCAATGGTTTCAGCCACTTTGGTTAATGAGTTAAGCTAATTTTTAAAGTCGCTCTCTCTATATATATTATTTATTTATTTATTTTTAACTTTATATAAAAAGTATTAACTCATTAACTAAAGCAACCAAACCCTTATGTATCAAGTGGTTTGACGGTTAATGATTGCATTAACTTTAGATTAACTAAGTAACCATAATTACTACACAGGTCACCTCATACTACCATAGACACTACTATTAGTGTCAAAGATGTGTCACAGTGTCCTAACAAGAAGTACAGTCGTTTTATGCCGTGAAAGTTATTTGACAATAAGCTAGGTCAAGTTAGACTGGTTTAGGCGTGTCAGTCTGAATTTTGTTCAGCTGACCGACAAACCAAAGACTAACGACCTAGGTTTATTGTTGTCAAATAAACCATGGAATAAATAGACTTAAGTTTGAATGTTGTTTGATTTAGATGCTAGCGTTTTGAGAGTGAATTATTGCTGAAAATAAAAAGAGGGCTGAAAGCCCAAAAAAAGCAGTCGCAAGACTGCTTTCTTCTTATCTTGATACTAGTAGAATTAACTCTCACGCAAAAAACATACCATTATATCAGTGTAAACCCTTGATATTACTGGTTTTTTGGGCAAAAAAAAAACCGTTTCATTTCTGAAAGGTTTCGTGTTATAATTTTATGTGTCGAAGGGGAAAAATATAAATACACGAAAGGAGAAATACGGATTTTTTTGCATCGCAAATTAATTTGTATATATAGTATAGC
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CCWAAGWMDAANTACABWBGTTTWWKSNTGTCAA

StartP-valueSite
5374.72e-14GACCGACAAACCAAAGACTAACGACCTAGGTTTATTGTTGTCAAATAAACCATG
4251.25e-13GTCACAGTGTCCTAACAAGAAGTACAGTCGTTTTATGCCGTGAAAGTTATTTGA
4757.92e-13TTGACAATAAGCTAGGTCAAGTTAGACTGGTTTAGGCGTGTCAGTCTGAATTTT
8671.92e-12TATAAATACACGAAAGGAGAAATACGGATTTTTTTGCATCGCAAATTAATTTGT

Motif SNGYTGAMVGVCAAA

StartP-valueSite
1358.61e-10GTTAATAATACCGTTGACCGCCAAAACCCTTTATA
5222.06e-08GAATTTTGTTCAGCTGACCGACAAACCAAAGACTA
6624.95e-08AATAAAAAGAGGGCTGAAAGCCCAAAAAAAGCAGT
8403.55e-07ATAATTTTATGTGTCGAAGGGGAAAAATATAAATA

Motif AGGGCG

StartP-valueSite
543.77e-05TCCAACAATTAGGGCGTCTTTCTTTT
223.77e-05TTTTATAATTAGGGCGTTTTATACCA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000010 100.0 924 0 0 1 924 1 924 0.0 1707
pORI00000108 86.7 203 24 3 636 836 1028 1229 0.0 222
pORI00000107 86.7 203 24 3 636 836 1425 1626 0.0 222