RefSeq NC_017531.1
Accession number NC_017531.1
DoriC accession number ORI96000392
OriC length 432 nt
OriC AT content 0.574074
The location of oriC region 3803155..3803586 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif AANASVTRDCGATCC

StartP-valueSite
2645.39e-09AGATATCCACAAGAGATGGCGATCCTAATAAGAGA
2061.18e-08ACCGATCATTAACAGGTAACGATCCTCTCTACTCA
3315.20e-07CTTTTCTTTTAATACCTGTCGATCCCGCTGCTTTC
181.12e-06AGGGATCGGGAAATCACGACGATCCCCAGCAGAAG
1061.65e-06AGTTGCGTATAACCGGTAGTTATCCAAAGAACAAC

Motif GGATCDGG

StartP-valueSite
104.81e-06GCCGGTCAGGGATCGGGAAATCACGAC
1851.19e-05CAGCTTATACGGATCAGGATCACCGATC
581.93e-05GTTTTTCCCCGGATCTGGTCTTTTATTT

Motif GTGGATAA

StartP-valueSite
1511.30e-05TTTATGAGCTGTGGATAAAGTCCTCTTT
771.30e-05CTTTTATTTTGTGGATAACTACCATGTT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96000392 100.0 432 0 0 1 432 1 432 0.0 798
ORI96000394 99.306 432 3 0 1 432 432 1 0.0 782
ORI95030438 98.843 432 5 0 1 432 432 1 0.0 771
ORI93020114 99.134 231 2 0 1 231 1 231 0.0 416
ORI94030322 81.206 431 66 14 9 432 10 432 0.0 333