RefSeq NC_013456.1
Accession number NC_013456.1
DoriC accession number ORI93020108
OriC length 477 nt
OriC AT content 0.63522
The location of oriC region 427440..427916 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TKTGWATAACTVC

StartP-valueSite
1105.48e-08CCAAACGAGCTGTGGATAACTACGATAAGATCC
1841.22e-07TTTTACCCTCTGTGTATAACTACCACTTTTGAT
522.23e-07TTTTCCCCAATGTGAATAACTCCCGTCAAATTA
761.22e-06GTCAAATTATTTTGTTTAACTGCTCAAAAACCA
4562.85e-06ATTAAATCCCTTTGAATACCTGAGGTCAGTTC

Motif GATMWGATCCAAWSAWKWTC

StartP-valueSite
2453.25e-11ATGATCACAAGATATGATCCAAAGAAGATCCATGATCTTG
2214.48e-11GGTAATCCTCGATCTGATCCAATCATGATCACAAGATATG
1231.91e-10GGATAACTACGATAAGATCCAGTGATTTTCCTTTAGTTAT

Motif CGGCTC

StartP-valueSite
4287.26e-05AGGTAAAATACGGCTCCTTTATCTGT
347.26e-05AGTCGAAATTCGGCTCTGTTTTCCCC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI93020108 100.0 477 0 0 1 477 1 477 0.0 881
ORI92220051 84.244 476 59 15 11 477 469 1 0.0 449
ORI94030347 85.714 259 28 9 109 362 98 352 0.0 265
ORI10020017 85.714 259 28 9 109 362 371 117 0.0 265
ORI10020013 85.328 259 29 9 109 362 98 352 0.0 259