RefSeq NC_012467.1
Accession number NC_012467.1
DoriC accession number ORI92710504
OriC length 158 nt
OriC AT content 0.746835
The location of oriC region 1559..1716 nt
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OriC map
OriC sequences
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dnaaTTTGTGGATAACTTTTAGTTTTTTATCTTTTTTATCCACATTTTTTAAACAAGCTAAAAAACTTGATAGGACTTGTTTAAAGGCTGTTTTCCACAGATTTCACAGACTCTATTATTACTATTATCTTTCTAATACTAAAAATAAATAAAGGAGAATCCdnan
dnaATTTGTGGATAACTTTTAGTTTTTTATCTTTTTTATCCACATTTTTTAAACAAGCTAAAAAACTTGATAGGACTTGTTTAAAGGCTGTTTTCCACAGATTTCACAGACTCTATTATTACTATTATCTTTCTAATACTAAAAATAAATAAAGGAGAATCCdnaN
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CACAGA

StartP-valueSite
1018.98e-05CCACAGATTTCACAGACTCTATTATT
928.98e-05GGCTGTTTTCCACAGATTTCACAGAC

Motif AWAGGAS

StartP-valueSite
1471.68e-05AAAAATAAATAAAGGAGAATCC
668.72e-05AAAAAACTTGATAGGACTTGTTTAAAG

Motif ARGCTR

StartP-valueSite
812.74e-05ACTTGTTTAAAGGCTGTTTTCCACAG
514.39e-04TTTTTTAAACAAGCTAAAAAACTTGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010304 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI92710504 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI40010239 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI10010044 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI96010202 99.367 158 1 0 1 158 1 158 0.0 287
ORI96010165 99.367 158 1 0 1 158 1 158 0.0 287
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ORI10010040 99.367 158 1 0 1 158 1 158 0.0 287
ORI96010298 97.959 147 2 1 13 158 21 167 0.0 254
ORI94010900 95.541 157 7 0 2 158 2 158 0.0 252
ORI93010638 94.904 157 8 0 2 158 2 158 0.0 246