RefSeq NC_012466.1
Accession number NC_012466.1
DoriC accession number ORI92710502
OriC length 158 nt
OriC AT content 0.753165
The location of oriC region 1559..1716 nt
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OriC map
OriC sequences
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dnaaTTTGTGGATAACTTTTAGTTTTTTATCTTTTTTATCCACATTTTTTAAACAAGCTAAAAAACTTGATATGACTTGTTTAAAGGCTGTTTTCCACAGATTTCACAGACTCTATTATTACTATTATCTTTCTAATACTAAAAATAAATAAAGGAGAATCCdnan
dnaATTTGTGGATAACTTTTAGTTTTTTATCTTTTTTATCCACATTTTTTAAACAAGCTAAAAAACTTGATATGACTTGTTTAAAGGCTGTTTTCCACAGATTTCACAGACTCTATTATTACTATTATCTTTCTAATACTAAAAATAAATAAAGGAGAATCCdnaN
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CACAGA

StartP-valueSite
1018.49e-05CCACAGATTTCACAGACTCTATTATT
928.49e-05GGCTGTTTTCCACAGATTTCACAGAC

Motif TAAAGG

StartP-valueSite
1461.69e-04TAAAAATAAATAAAGGAGAATCC
781.69e-04ATGACTTGTTTAAAGGCTGTTTTCCA

Motif RACTTG

StartP-valueSite
709.31e-05AACTTGATATGACTTGTTTAAAGGCT
603.88e-04CAAGCTAAAAAACTTGATATGACTTG
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010202 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI96010165 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI96010163 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
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ORI94010740 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI94010738 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
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ORI92310375 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI10010040 100.0 158 0 0 1 158 1 158 0.0 292
ORI96010304 99.367 158 1 0 1 158 1 158 0.0 287
ORI92710504 99.367 158 1 0 1 158 1 158 0.0 287
ORI40010239 99.367 158 1 0 1 158 1 158 0.0 287
ORI10010044 99.367 158 1 0 1 158 1 158 0.0 287
ORI96010298 98.639 147 1 1 13 158 21 167 0.0 259
ORI94010900 96.178 157 6 0 2 158 2 158 0.0 257
ORI93010638 95.541 157 7 0 2 158 2 158 0.0 252