RefSeq NC_012726.1
DoriC accession number aORI10010076
OriC length 453 nt
OriC AT content 0.7307
The location of oriC region 389..841 nt
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OriC map
OriC sequences
TTTTAGAGTCTATAACTGTTAAGATTCTAACAGTTTTGAAAAAGATTAATAAGTAACCTTTTTTTAACTTAAATATGTGTCAATGGTAATCAGACGTATGTTTATAAAGTCTACCTTAGCCGTCTCTTTTTCAATATCGTATTTATTGTATATTATTGCTAAGATATCTTTCGGATCTGGTAAACTCGCCTTTATTATAGCATTGTTACAATTATATCCTTATTTCCTAATCGATTATTTGCCTACAGTACAAGTTGTTTCGTTGTTCTTCCAATCTCTTTTATTACTTCTTTTCGCTATTTTCATTTTATTGATTACTTACATGTTATTTTTATTCTACAAATTATACAAAATGGTAAAAACTTCAATTTTGAAGTAATATTGATATAACCTGTGGTCTAGATATTACCAATACAGTCATAGGAAACAGGTTTAACAGTAGAAACATTAGAA
TTTTAGAGTCTATAACTGTTAAGATTCTAACAGTTTTGAAAAAGATTAATAAGTAACCTTTTTTTAACTTAAATATGTGTCAATGGTAATCAGACGTATGTTTATAAAGTCTACCTTAGCCGTCTCTTTTTCAATATCGTATTTATTGTATATTATTGCTAAGATATCTTTCGGATCTGGTAAACTCGCCTTTATTATAGCATTGTTACAATTATATCCTTATTTCCTAATCGATTATTTGCCTACAGTACAAGTTGTTTCGTTGTTCTTCCAATCTCTTTTATTACTTCTTTTCGCTATTTTCATTTTATTGATTACTTACATGTTATTTTTATTCTACAAATTATACAAAATGGTAAAAACTTCAATTTTGAAGTAATATTGATATAACCTGTGGTCTAGATATTACCAATACAGTCATAGGAAACAGGTTTAACAGTAGAAACATTAGAA
TTTTAGAGTCTATAACTGTTAAGATTCTAACAGTTTTGAAAAAGATTAATAAGTAACCTTTTTTTAACTTAAATATGTGTCAATGGTAATCAGACGTATGTTTATAAAGTCTACCTTAGCCGTCTCTTTTTCAATATCGTATTTATTGTATATTATTGCTAAGATATCTTTCGGATCTGGTAAACTCGCCTTTATTATAGCATTGTTACAATTATATCCTTATTTCCTAATCGATTATTTGCCTACAGTACAAGTTGTTTCGTTGTTCTTCCAATCTCTTTTATTACTTCTTTTCGCTATTTTCATTTTATTGATTACTTACATGTTATTTTTATTCTACAAATTATACAAAATGGTAAAAACTTCAATTTTGAAGTAATATTGATATAACCTGTGGTCTAGATATTACCAATACAGTCATAGGAAACAGGTTTAACAGTAGAAACATTAGAA
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GGTAAWCWSRCS

StartP-valueSite
1794.97e-08TTTCGGATCTGGTAAACTCGCCTTTATTATAG
851.06e-07ATGTGTCAATGGTAATCAGACGTATGTTTATA

Motif CAKTASAA

StartP-valueSite
4378.98e-06ACAGGTTTAACAGTAGAAACATTAGAA
2461.95e-05TATTTGCCTACAGTACAAGTTGTTTCGT
4464.96e-05ACAGTAGAAACATTAGAA

Motif GAAAMAG

StartP-valueSite
4242.15e-05ACAGTCATAGGAAACAGGTTTAACAGT
386.69e-05TAACAGTTTTGAAAAAGATTAATAAGT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010076 100.0 453 0 0 1 453 1 453 0.0 837
aORI10010088 99.117 453 2 2 1 453 3 453 0.0 813
aORI10010064 99.117 453 2 2 1 453 3 453 0.0 813
aORI10010070 99.117 453 1 2 1 453 4 453 0.0 811
aORI10010067 98.896 453 2 2 1 453 4 453 0.0 806
aORI10010073 98.675 453 3 2 1 453 4 453 0.0 800
aORI10010061 98.675 453 3 2 1 453 4 453 0.0 800
aORI10010267 98.649 74 1 0 380 453 1 74 2.02e-32 132
aORI10010115 98.649 74 1 0 380 453 1 74 2.02e-32 132
aORI10010112 98.649 74 1 0 380 453 1 74 2.02e-32 132