RefSeq NZ_CP024440
DoriC accession number pORI00001043
OriC length 623 nt
OriC AT content 0.6677
The location of oriC region 4064..150 nt
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OriC map
OriC sequences
AAAAAATCGACTCCTTAATCTCAATTTCGTTTAAGGAATCGCTCACCCAAATATATATCTTGATGTATATTTAAATATCGTTTAATATCTAAATATACAAGATTATAAAAACAACTCAGTGTTTTTTTCTTTGAATGATGTCGTTCACAAACTTTGGTCAGGGCGTGAGCGACTCCTTTTTATTTTGTTATTAATATAACACTATCAAAAGACTTGGTCTAATCAGATCAAGTCTTTTTTTATTTAAGCATTTGTATTATCTGGTAAACAGTTAAAACTACTAAAACACCAAGTACATACTTACTTGTTATAAAATTCTCAAAGGCTTCTCTGAATTTCATTTCTTCAACTCCTTTTATTGCTTTATTCCAATTTCCTTATTGGTCGGAACCTACAGGGCTTTATGTGTTGTTGAGTTGGTACTTTCTTGGGATTAATCCCAATTCAAGTCCAACCAACTCGCTAACAAGTTACTTATTGGTCGGAACCTACAGGGCTTTATGTGTTGTTGAGTTGGTACTTTCTTGGGATTAATCCCAATTCAAGTCCAACCAACTCGCTAACAAGTTAGCTAACACATAGCCCATTCCAACCAATAAGTTTTCTCGGCATAAATGCATGTT
AAAAAATCGACTCCTTAATCTCAATTTCGTTTAAGGAATCGCTCACCCAAATATATATCTTGATGTATATTTAAATATCGTTTAATATCTAAATATACAAGATTATAAAAACAACTCAGTGTTTTTTTCTTTGAATGATGTCGTTCACAAACTTTGGTCAGGGCGTGAGCGACTCCTTTTTATTTTGTTATTAATATAACACTATCAAAAGACTTGGTCTAATCAGATCAAGTCTTTTTTTATTTAAGCATTTGTATTATCTGGTAAACAGTTAAAACTACTAAAACACCAAGTACATACTTACTTGTTATAAAATTCTCAAAGGCTTCTCTGAATTTCATTTCTTCAACTCCTTTTATTGCTTTATTCCAATTTCCTTATTGGTCGGAACCTACAGGGCTTTATGTGTTGTTGAGTTGGTACTTTCTTGGGATTAATCCCAATTCAAGTCCAACCAACTCGCTAACAAGTTACTTATTGGTCGGAACCTACAGGGCTTTATGTGTTGTTGAGTTGGTACTTTCTTGGGATTAATCCCAATTCAAGTCCAACCAACTCGCTAACAAGTTAGCTAACACATAGCCCATTCCAACCAATAAGTTTTCTCGGCATAAATGCATGTT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GGTCGGAACCTACAGGGCTTTATGTGTTGTTGAGTTGGTACTTTCTTGGG

StartP-valueSite
4804.21e-32GTTACTTATTGGTCGGAACCTACAGGGCTTTATGTGTTGTTGAGTTGGTACTTTCTTGGGATTAATCCCA
3834.21e-32TTTCCTTATTGGTCGGAACCTACAGGGCTTTATGTGTTGTTGAGTTGGTACTTTCTTGGGATTAATCCCA

Motif TAAYMCMWATYCMAKTCCAACCAAYWMGYTWWCWMGTYA

StartP-valueSite
5321.35e-22TTCTTGGGATTAATCCCAATTCAAGTCCAACCAACTCGCTAACAAGTTAGCTAACACAT
4351.35e-22TTCTTGGGATTAATCCCAATTCAAGTCCAACCAACTCGCTAACAAGTTACTTATTGGTC
5734.34e-17ACAAGTTAGCTAACACATAGCCCATTCCAACCAATAAGTTTTCTCGGCATAAATGCATG

Motif CRACTCCTT

StartP-valueSite
1702.80e-06AGGGCGTGAGCGACTCCTTTTTATTTTGT
82.80e-06AAAAAATCGACTCCTTAATCTCAATT
3478.72e-06TTCATTTCTTCAACTCCTTTTATTGCTTT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00001043 100.0 623 0 0 1 623 1 623 0.0 1151
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pORI00000288 99.789 473 1 0 1 473 526 54 0.0 869
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pORI00000027 97.987 149 3 0 467 615 354 206 0.0 259
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pORI00000027 97.656 128 3 0 346 473 378 251 0.0 220