RefSeq NC_005243
DoriC accession number pORI00000027
OriC length 766 nt
OriC AT content 0.6854
The location of oriC region 3762..4527 nt
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OriC map
OriC sequences
TGTTGATACTTTATGCAGTACCCTATGTATTCTTCGCTATCATTCTGTGGCTCATAGCATTGTTTTTTAGAGTATTTAATGACCTTTAGGTAGATTTATATATAAAAAGGGCTAAATACGCAAAATACCCCCTTAAAATGCAAAATAAATGCAAATAAGGGGGTAACTCCTTATGAAAAAACAACTAATAGTATTATAACACGTTTTTATGCCGAGAAAACTTATTGGTTGGAATGGGCTATGTGTTAGCTAACTTGTTAGCGAGTTGGTTGGACTTGAATTGGGATTAATCCCAAGAAAGTACCAACTCAACAACACATAAAGCCCTGTAGGTTCCGACGAATAAGGAAATTGGAATAAAGCAACGAAAGGAGTTGAGGTAAAATGAGTGAGAAAACGAAGAAAATCATTCGAGTATCATTAGCTTTTTCACAAGTAGTAGTGCAATCATTGATAGTTTATTATACTTACCAGCAATATAAATTATCTAAAGAGAATTAAGTTTTGATTATGTAATAAGTTTTGGTACTAAAAAAGACTTGATCTAATTAGACCAAGTCTTTTGATAGTGTTATATTAATAACAAAGTAAAAAGAAGTCGCTCACTCCCTCGCCAAAGTTTGTGATAGCGACTTACCTTAAAGAAAAACAGTTGATGTTTTTGTTCTTAATTTGTATATCTAGATATTAAACGATATTAGTTTATTCTTCAAGATATATATTCGGGTGAGCGACTTCTTAAATTAAATTAAGGAGTCGATTTTTT
TGTTGATACTTTATGCAGTACCCTATGTATTCTTCGCTATCATTCTGTGGCTCATAGCATTGTTTTTTAGAGTATTTAATGACCTTTAGGTAGATTTATATATAAAAAGGGCTAAATACGCAAAATACCCCCTTAAAATGCAAAATAAATGCAAATAAGGGGGTAACTCCTTATGAAAAAACAACTAATAGTATTATAACACGTTTTTATGCCGAGAAAACTTATTGGTTGGAATGGGCTATGTGTTAGCTAACTTGTTAGCGAGTTGGTTGGACTTGAATTGGGATTAATCCCAAGAAAGTACCAACTCAACAACACATAAAGCCCTGTAGGTTCCGACGAATAAGGAAATTGGAATAAAGCAACGAAAGGAGTTGAGGTAAAATGAGTGAGAAAACGAAGAAAATCATTCGAGTATCATTAGCTTTTTCACAAGTAGTAGTGCAATCATTGATAGTTTATTATACTTACCAGCAATATAAATTATCTAAAGAGAATTAAGTTTTGATTATGTAATAAGTTTTGGTACTAAAAAAGACTTGATCTAATTAGACCAAGTCTTTTGATAGTGTTATATTAATAACAAAGTAAAAAGAAGTCGCTCACTCCCTCGCCAAAGTTTGTGATAGCGACTTACCTTAAAGAAAAACAGTTGATGTTTTTGTTCTTAATTTGTATATCTAGATATTAAACGATATTAGTTTATTCTTCAAGATATATATTCGGGTGAGCGACTTCTTAAATTAAATTAAGGAGTCGATTTTTT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CSCTCRC

StartP-valueSite
6082.75e-06GTCGCTCACTCCCTCGCCAAAGTTTGT
6001.90e-05AAAAAGAAGTCGCTCACTCCCTCGCCA

Motif YKKGWKAGCGASTT

StartP-valueSite
7243.03e-09GATATATATTCGGGTGAGCGACTTCTTAAATTAA
2543.66e-08TGTTAGCTAACTTGTTAGCGAGTTGGTTGGACTT
6224.33e-08CGCCAAAGTTTGTGATAGCGACTTACCTTAAAGA

Motif SCCMWGWARGTWCCRAC

StartP-valueSite
3241.35e-11AACACATAAAGCCCTGTAGGTTCCGACGAATAAGGAA
2927.37e-10TGGGATTAATCCCAAGAAAGTACCAACTCAACAACAC
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000027 100.0 766 0 0 1 766 1 766 0.0 1415
pORI00000288 98.266 173 3 0 206 378 9 181 0.0 303
pORI00000288 83.74 246 24 11 531 766 287 526 0.0 219
pORI00000237 98.266 173 3 0 206 378 9 181 0.0 303
pORI00000237 85.185 216 24 7 531 743 287 497 0.0 215
pORI00001043 97.987 149 3 0 206 354 615 467 0.0 259
pORI00001043 84.146 246 23 11 531 766 240 1 0.0 224
pORI00001043 95.652 138 4 2 251 388 473 338 0.0 220