RefSeq NC_018068.1
Accession number NC_018068.1
DoriC accession number ORI96010239
OriC length 367 nt
OriC AT content 0.705722
The location of oriC region 213..579 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGKATAAC

StartP-valueSite
1185.37e-07TCATGTAGGATGTGGATAACATAAGGACTA
3082.49e-06TGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTATTG
2963.53e-06TATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATA
1855.14e-06GAAATCTTCCTGTTGATAACCCTTAAAAAA

Motif RTTATCCAC

StartP-valueSite
2843.67e-06ATTTGATCAAGTTATCCACAAATGTGTAT
1443.67e-06ACTAAAAATAGTTATCCACTGTGAATAAT
2571.49e-05TCTTATTTTTATTATCCACAACTAGCAAT

Motif GRSASSTCC

StartP-valueSite
3558.52e-08TTTTAAACAAGGGAGGTCCATTC
75.82e-06TTTAAAGACACCTCCTTTTTTAAAC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010239 100.0 367 0 0 1 367 1 367 0.0 678
ORI96010268 78.947 342 49 20 34 363 26 356 0.0 211
ORI95010942 77.632 304 51 15 67 363 62 355 5.46506e-43 169
ORI92710474 77.377 305 53 16 67 364 56 351 1.96042e-42 167
ORI10010187 77.377 305 53 16 67 364 56 351 1.96042e-42 167
ORI96010231 76.285 253 46 13 118 364 117 361 4.31e-29 122