RefSeq NC_007907.1
Accession number NC_007907.1
DoriC accession number ORI10010187
OriC length 355 nt
OriC AT content 0.678873
The location of oriC region 5727180..5727534 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGDATAACT

StartP-valueSite
1072.83e-07ACAATTAGATTGTGGATAACTTAAGCTCCGG
2961.34e-06TGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTATTGT
2843.53e-06TATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAA
1737.22e-06ACTAACTTCCTGTTGATAACCCCAAAAAAAA
1421.09e-05GTTATCCACCTGTGAATAAATTTATATTAGG

Motif TRCACMKC

StartP-valueSite
2091.24e-05ATTATGATTTTACACCGCCTTTAATTTC
91.82e-05ACTGCTATTGCACCTCCTTCAAGGGA
2502.83e-05TTATCATTTGTACACAGCAATAATTTTA
433.90e-05AAATAAAAATTGCACATCTCTAGAGATT

Motif AAGGGA

StartP-valueSite
3401.09e-04TAATTAGACAAAGGGAGGTCCACTGA
211.09e-04CACCTCCTTCAAGGGAAAAAACAAAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10010187 100.0 355 0 0 1 355 1 355 0.0 656
ORI92710474 99.718 355 1 0 1 355 1 355 0.0 651
ORI96010231 90.411 365 25 2 1 355 1 365 0.0 472
ORI96010239 77.377 305 53 16 56 351 67 364 1.90016e-42 167
ORI95010942 74.757 309 61 15 50 350 56 355 4.16e-29 122
ORI96010268 88.172 93 8 3 260 350 265 356 1.17e-24 108