RefSeq NC_016584.1
Accession number NC_016584.1
DoriC accession number ORI95010942
OriC length 358 nt
OriC AT content 0.701117
The location of oriC region 159..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTKKATAAC

StartP-valueSite
1137.15e-07TTTGACACTGTGTGGATAACTTGTAATTTT
3023.09e-06TGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTATTG
1796.70e-06ATTATATTCCTGTTGATAACCCACAGGAAA
2908.57e-06TATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATA
2432.05e-05CAACAAATCGTGTTTATACCTATTCACAAC

Motif ACRACACC

StartP-valueSite
53.76e-06TTCAACGACACCTCCTTTATAT
2583.04e-05ATACCTATTCACAACACGTAATTTGTTT
2263.04e-05ACAATACCTGACGACAACAACAAATCGT
2168.91e-05TTATAATTTTACAATACCTGACGACAAC

Motif GWCAAGSRARG

StartP-valueSite
3421.06e-08TTCATTTTTAGACAAGGGAGGTCCGTC
896.13e-07ATTTTATTCTGTCAAGCAAAGGACTTTGACA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI95010942 100.0 358 0 0 1 358 1 358 0.0 662
ORI96010268 88.981 363 31 8 1 358 1 359 0.0 440
ORI96010239 77.632 304 51 14 62 355 67 363 5.32493e-43 169
ORI92710474 75.161 310 58 17 56 355 50 350 9.03e-31 128
ORI10010187 74.839 310 59 17 56 355 50 350 4.2e-29 122