RefSeq NC_018017.1
Accession number NC_018017.1
DoriC accession number ORI96010231
OriC length 365 nt
OriC AT content 0.690411
The location of oriC region 215..579 nt
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OriC map
OriC sequences
-ACAGCTATTGCACCTCCTTCAAGGGAAAAAACAAATAAAAATTGCACATCTCTAGAGATTATACTCTAACTTTTTTGGCCCTGTCAAGCAGAGTATATAAGAGTATGCAATAATATTGTGGATAACTTTACCCTTAAAAAAGTTATCCACTTGTTAATAAATTTTTATTAGGACTAACTTCCTGTTGATAACCCCAAAAAAAATTGGTATTATGATTTTACACCGCCTTTAAATACCACGCTTTCGCTTAAATCATTTGTACACAGCAATAATTTTATTGAGTTATCCACAAATGTGCATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTATTGTCATATTTTCTACATAATTAGACAAAGGGAGGTCCACTGAdnaA
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-ACAGCTATTGCACCTCCTTCAAGGGAAAAAACAAATAAAAATTGCACATCTCTAGAGATTATACTCTAACTTTTTTGGCCCTGTCAAGCAGAGTATATAAGAGTATGCAATAATATTGTGGATAACTTTACCCTTAAAAAAGTTATCCACTTGTTAATAAATTTTTATTAGGACTAACTTCCTGTTGATAACCCCAAAAAAAATTGGTATTATGATTTTACACCGCCTTTAAATACCACGCTTTCGCTTAAATCATTTGTACACAGCAATAATTTTATTGAGTTATCCACAAATGTGCATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTATTGTCATATTTTCTACATAATTAGACAAAGGGAGGTCCACTGAdnaA
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGBATAAC

StartP-valueSite
1177.34e-07GCAATAATATTGTGGATAACTTTACCCTTA
3064.11e-06TGCATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTATTG
2944.84e-06TATCCACAAATGTGCATAAGTTTGTGTATA
1836.69e-06ACTAACTTCCTGTTGATAACCCCAAAAAAA

Motif TRCACMKC

StartP-valueSite
2191.68e-05ATTATGATTTTACACCGCCTTTAAATAC
91.68e-05ACAGCTATTGCACCTCCTTCAAGGGA
2603.76e-05AAATCATTTGTACACAGCAATAATTTTA
433.76e-05AAATAAAAATTGCACATCTCTAGAGATT

Motif GWTATCCAC

StartP-valueSite
2826.95e-06ATTTTATTGAGTTATCCACAAATGTGCAT
1426.95e-06CCTTAAAAAAGTTATCCACTTGTTAATAA
3547.51e-06TAGACAAAGGGAGGTCCACTGA

Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010231 100.0 365 0 0 1 365 1 365 0.0 675
ORI10010187 90.411 365 25 2 1 365 1 355 0.0 472
ORI92710474 90.137 365 26 2 1 365 1 355 0.0 466
ORI96010239 76.285 253 46 13 117 361 118 364 4.29e-29 122
ORI95010942 76.587 252 42 15 117 360 113 355 4.29e-29 122
ORI96010268 88.172 93 8 3 270 360 265 356 1.2e-24 108