RefSeq NC_015431.1
Accession number NC_015431.1
DoriC accession number ORI94010839
OriC length 293 nt
OriC AT content 0.795222
The location of oriC region 1153982..276 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CCACDWHTTMC

StartP-valueSite
21.18e-07ACCACTACCTCCTTTACAAAAA
2392.88e-07AGGATTTTTTCCACGTTTTCCACATTTTTAA
1155.77e-06GTAGATAAAACCACAAATTACTAACAAAAAT

Motif GTWGATAA

StartP-valueSite
2841.30e-05TAATATTTTTGGAGACAAAT
1554.37e-05TTGTTGATAAGTTGATAACTATAAAATA
1474.37e-05TTAGTTAATTGTTGATAAGTTGATAACT
1057.69e-05TCAATTAAATGTAGATAAAACCACAAAT

Motif MACACC

StartP-valueSite
344.97e-05ATAAATAATTCACACCTAATTATATA
1722.06e-04ACTATAAAATAACACCATTAAAATAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI94010839 100.0 293 0 0 1 293 1 293 0.0 542
ORI10010103 96.887 257 7 1 37 293 1 256 0.0 429
ORI10010178 87.542 297 27 10 3 293 3 295 0.0 335
ORI96040576 87.162 296 29 8 3 293 3 294 0.0 327
ORI94040271 87.162 296 29 8 3 293 3 294 0.0 327