RefSeq NC_007633.1
Accession number NC_007633.1
DoriC accession number ORI10010178
OriC length 295 nt
OriC AT content 0.81017
The location of oriC region 1009729..1010023 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTWGATAA

StartP-valueSite
2864.66e-06TAATATTTTTGGAGATAAAT
1063.41e-05TCAATTAAATGTAGATAAAACTAAAAAT
1565.94e-05TTGTTGATAAGTTGATAAATAATAAATT
1485.94e-05TTAGTTAATTGTTGATAAGTTGATAAAT

Motif SRHTTWYCWCM

StartP-valueSite
35.65e-07ATCACTTACCTCCTTTACAAAAA
2311.07e-06TATAATGTATGGATTTTCTCCACGTTTTCCA
2432.01e-06ATTTTCTCCACGTTTTCCACATTTTTAACAA

Motif CAAGKM

StartP-valueSite
1745.64e-05ATAATAAATTCAAGGAACTAATTAAG
2611.24e-04ACATTTTTAACAAGTCTTTACTTTAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10010178 100.0 295 0 0 1 295 1 295 0.0 545
ORI96040576 92.905 296 18 3 1 295 1 294 0.0 427
ORI94040271 92.905 296 18 3 1 295 1 294 0.0 427
ORI94010839 87.542 297 27 10 3 295 3 293 0.0 335
ORI10010103 85.714 259 33 4 38 295 1 256 0.0 270