RefSeq NC_013642.1
Accession number NC_013642.1
DoriC accession number ORI93030276
OriC length 557 nt
OriC AT content 0.651706
The location of oriC region 807603..808159 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif RGTGGTAGGT

StartP-valueSite
3646.22e-07TACAGAGTTTGGTGGTAGGTTTGTTTTGCA
1476.22e-07TTACCACCCGGGTGGTAGGTAAGTGGTAGG
696.22e-07AGGGGACGCAGGTGGTAGGTTTCGAGTATT
1691.65e-06GTGGTAGGTAAGTGGTAGGTTTCTCTGAAA
1581.65e-06GTGGTAGGTAAGTGGTAGGTAAGTGGTAGG

Motif AACCTACCACC

StartP-valueSite
4694.77e-08ATGTACACAAAACCTACCACCAAACCTACCA
3194.77e-08GAGCTTCAGAAACCTACCACCCTGAAGTTGT
1343.54e-07TAATGTCTGCAACTTACCACCCGGGTGGTAG
4811.01e-06CCTACCACCAAACCTACCATTTTAGTTTCAG

Motif CTRAAATNGTC

StartP-valueSite
1838.47e-07GTAGGTTTCTCTGAAATCGGCTTGGATACTG
3411.89e-06TGAAGTTGTCCTAAAATGGTCAATACAGAGT
2893.61e-06TTTGTAAAGACTAAAATAGTCTATTGATGAG
3304.92e-06ACCTACCACCCTGAAGTTGTCCTAAAATGGT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI93030276 100.0 557 0 0 1 557 1 557 0.0 1029
ORI90030156 100.0 557 0 0 1 557 557 1 0.0 1029
ORI92530208 98.384 557 9 0 1 557 557 1 0.0 979
ORI10030002 95.691 557 23 1 2 557 1 557 0.0 894