RefSeq NC_010483.1
Accession number NC_010483.1
DoriC accession number ORI92530208
OriC length 557 nt
OriC AT content 0.651706
The location of oriC region 821694..822250 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif ACCTACCACC

StartP-valueSite
4807.60e-07AATACTCGAAACCTACCACCTGCGTCCCCT
4027.60e-07CCTACCACTTACCTACCACCCGGGTGGTAA
3387.60e-07GTTGCAGAAAACCTACCACCTAAAATCCAG
1857.60e-07TGCAAAGCAAACCTACCACCAAACTCTGTA
3801.96e-06TTTCAGAGAAACCTACCACTTACCTACCAC

Motif GGTGGTARG

StartP-valueSite
2293.81e-07ACAACTTCAGGGTGGTAGGTTTCTGAAGC
793.81e-07TGGTAGGTTTGGTGGTAGGTTTTGTATAC
4141.23e-06CTACCACCCGGGTGGTAAGTTGCAGACAT
5469.49e-06TCTGAAAAGAGGTGGTAAAAAA
671.52e-05CTGAAACTAAAATGGTAGGTTTGGTGGTA

Motif GACNATTTYAG

StartP-valueSite
2071.04e-06ACTCTGTATTGACCATTTTAGGACAACTTCA
3652.57e-06CAGTATCCAAGCCGATTTCAGAGAAACCTAC
2596.16e-06CTCATCAATAGACTATTTTAGTCTTTACAAA
2188.03e-06ACCATTTTAGGACAACTTCAGGGTGGTAGGT
3249.44e-06TCCTTTTAATGAGCGTTGCAGAAAACCTACC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI92530208 100.0 557 0 0 1 557 1 557 0.0 1029
ORI93030276 98.384 557 9 0 1 557 557 1 0.0 979
ORI90030156 98.384 557 9 0 1 557 1 557 0.0 979
ORI10030002 96.948 557 16 1 1 556 557 1 0.0 933