RefSeq NC_009486.1
Accession number NC_009486.1
DoriC accession number ORI90030156
OriC length 557 nt
OriC AT content 0.651706
The location of oriC region 786686..787242 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif ACCTACCACY

StartP-valueSite
4806.22e-07AATACTCGAAACCTACCACCTGCGTCCCCT
4026.22e-07CCTACCACTTACCTACCACCCGGGTGGTAA
1856.22e-07TGCAAAACAAACCTACCACCAAACTCTGTA
3911.65e-06CCTACCACTTACCTACCACTTACCTACCAC
3801.65e-06TTTCAGAGAAACCTACCACTTACCTACCAC

Motif GGTGGTAGGTT

StartP-valueSite
2294.77e-08ACAACTTCAGGGTGGTAGGTTTCTGAAGCTC
794.77e-08TGGTAGGTTTGGTGGTAGGTTTTGTGTACAT
4143.54e-07CTACCACCCGGGTGGTAAGTTGCAGACATTA
671.01e-06CTGAAACTAAAATGGTAGGTTTGGTGGTAGG

Motif GACNATTTYAG

StartP-valueSite
3658.47e-07CAGTATCCAAGCCGATTTCAGAGAAACCTAC
2071.89e-06ACTCTGTATTGACCATTTTAGGACAACTTCA
2593.61e-06CTCATCAATAGACTATTTTAGTCTTTACAAA
2184.92e-06ACCATTTTAGGACAACTTCAGGGTGGTAGGT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI93030276 100.0 557 0 0 1 557 557 1 0.0 1029
ORI90030156 100.0 557 0 0 1 557 1 557 0.0 1029
ORI92530208 98.384 557 9 0 1 557 1 557 0.0 979
ORI10030002 95.691 557 23 1 1 556 557 1 0.0 894