RefSeq NC_000853.1
Accession number NC_000853.1
DoriC accession number ORI10030002
OriC length 557 nt
OriC AT content 0.653501
The location of oriC region 156961..157517 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GGTGGTAGGT

StartP-valueSite
3648.58e-07TACAGAGTTTGGTGGTAGGTTTGCTTTGCA
2118.58e-07CTGGATTTTAGGTGGTAGGTTTTCTGTAAC
1478.58e-07TTACCACCCGGGTGGTAGGTAAGTGGTAGG
698.58e-07AGGGGACGCAGGTGGTAGGTTTCGAGTATT
1692.18e-06GTGGTAGGTAAGTGGTAGGTTTCTCTGAAA

Motif AAACCTACCAC

StartP-valueSite
4686.22e-08AATGTACACAAAACCTACCACTAAACCTACC
3186.22e-08AGAGATTCAGAAACCTACCACACTGAAGTTG
4803.85e-07ACCTACCACTAAACCTACCATTTTAGTTTCA
1335.21e-07ATGATGTCTGCAACTTACCACCCGGGTGGTA

Motif CTRAAATNGTC

StartP-valueSite
1836.67e-07GTAGGTTTCTCTGAAATCGGCTTGGATACTG
3411.40e-06TGAAGTTGTCCTAAAATGGTCAATACAGAGT
2892.78e-06TTTGTAAAGACTAAAATAGTCTATTGATGAG
3304.59e-06ACCTACCACACTGAAGTTGTCCTAAAATGGT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI10030002 100.0 557 0 0 1 557 1 557 0.0 1029
ORI92530208 96.948 557 16 1 1 557 556 1 0.0 933
ORI93030276 95.691 557 23 1 1 557 2 557 0.0 894
ORI90030156 95.691 557 23 1 1 557 556 1 0.0 894