RefSeq GCF_000143865.1
Accession number NC_021025.1
DoriC accession number ORI97010254
OriC length 292 nt
OriC AT content 0.804795
The location of oriC region 1193524..7 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CCACDWHTTMC

StartP-valueSite
26.19e-08ACCACTACCTCCTTTACAAAAA
2382.13e-07AGGATTTTTTCCACGTTTTCCACATTTTTAA
1154.53e-06GTAGATAAAACCACAAATTACTAACAGAAAT

Motif GTWGATAA

StartP-valueSite
2833.14e-06TAATATTTTTGGAGACAAAT
1557.99e-05TTGTTGATAAGTTGATAACTATAAAATA
1477.99e-05TTAGTTAATTGTTGATAAGTTGATAACT
1057.99e-05TAAATTAAATGTAGATAAAACCACAAAT

Motif TTTWGC

StartP-valueSite
532.24e-04TTATATAATATTTTGCTTTAAAAATA
864.57e-04AGACTTAATTTTTAGCTTCTAAATTA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI94010839 97.27 293 7 1 1 292 1 293 0.0 496
ORI10010103 100.0 256 0 0 37 292 1 256 0.0 473
ORI10010178 87.075 294 33 5 3 292 3 295 0.0 327
ORI96040576 86.735 294 33 6 3 292 3 294 0.0 322
ORI94040271 86.735 294 33 6 3 292 3 294 0.0 322