RefSeq NZ_CP013337
DoriC accession number pORI00000768
OriC length 1079 nt
OriC AT content 0.7729
The location of oriC region 3670..4748 nt
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OriC map
OriC sequences
AAAAATCACTCCCCTTTTTATCTTAGTAATATATATTACTATAATATTACTAAGTTTTAACATAGCATAAATTCACGAGTTCAATCGGTAATATTTATTACTACAATATTACTTTATTCCTTCAACAGTATACACCTGTTTTTATAAAAAATAAAGAGTTTTTTTTATGCAGAAAAAATATTTAAATTAATTTTATAAAAAATCTCTAAAATCAATTTTAAGGCTTTTTATTTTATTGAGCCATACTTTTTATCGTTAAAATGTTTAAAATCATTTTTAGGACTATCCTAGAACTTTTAAATTGATTTTTAAATGATGTTTGTATGTTAAATTTCTTTTTGTTTTTTTAAATAAAAAAAGTTAGGCATTGTGAGAGTCCTAACTTTTTATGTCGTTTTGTTCAAGCAACGGATACTGTGTTGCTATGTTTCAAATTAATTATATCACATTCAATTTTTAATTTCAATATGTTATAATTCTAACTGTCGTTTCCTCCAAAGGAGGTGAAAGATGTTCAAGGAATGGATACTATTGATAATGGCTTTAATATTTATTGCTATTTTACAATATGCAGTTATATTAATATGGCTTCACATTATCACAAGTTTATTAGCATAGTTCTTGTAAAAAATAATGCTAGGGAGTTAGTAAAGTGTGAGAGCTTGAAAACTTTCTTTTATTTTTTAGGGAAAATATATTTATTTTCAATATTTTTTTACCGAAAGTTGAAAATCCACTTTCGGTAATTTTTTTAATTTTTTTATTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAAATCACATTACTAATATGATTAATATAATAATATTATATAATAATATATAATACAGCACTCATTTTTCTTTTTAATAGCAATGTAAAACAAAAAGATAATAGGACAAATTTTCAAGATAATAGGACAAATTTTCAACTTAAAACAGGACAAATTTTCAACTTAATAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTAATAGGACAAATTTCGTTGACAGTCTTATATTATTGGTGTATAATGTTTTTATGAAATAAAATTTCCATAAAAGGAGCTGAAGATTTTA
AAAAATCACTCCCCTTTTTATCTTAGTAATATATATTACTATAATATTACTAAGTTTTAACATAGCATAAATTCACGAGTTCAATCGGTAATATTTATTACTACAATATTACTTTATTCCTTCAACAGTATACACCTGTTTTTATAAAAAATAAAGAGTTTTTTTTATGCAGAAAAAATATTTAAATTAATTTTATAAAAAATCTCTAAAATCAATTTTAAGGCTTTTTATTTTATTGAGCCATACTTTTTATCGTTAAAATGTTTAAAATCATTTTTAGGACTATCCTAGAACTTTTAAATTGATTTTTAAATGATGTTTGTATGTTAAATTTCTTTTTGTTTTTTTAAATAAAAAAAGTTAGGCATTGTGAGAGTCCTAACTTTTTATGTCGTTTTGTTCAAGCAACGGATACTGTGTTGCTATGTTTCAAATTAATTATATCACATTCAATTTTTAATTTCAATATGTTATAATTCTAACTGTCGTTTCCTCCAAAGGAGGTGAAAGATGTTCAAGGAATGGATACTATTGATAATGGCTTTAATATTTATTGCTATTTTACAATATGCAGTTATATTAATATGGCTTCACATTATCACAAGTTTATTAGCATAGTTCTTGTAAAAAATAATGCTAGGGAGTTAGTAAAGTGTGAGAGCTTGAAAACTTTCTTTTATTTTTTAGGGAAAATATATTTATTTTCAATATTTTTTTACCGAAAGTTGAAAATCCACTTTCGGTAATTTTTTTAATTTTTTTATTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAAATCACATTACTAATATGATTAATATAATAATATTATATAATAATATATAATACAGCACTCATTTTTCTTTTTAATAGCAATGTAAAACAAAAAGATAATAGGACAAATTTTCAAGATAATAGGACAAATTTTCAACTTAAAACAGGACAAATTTTCAACTTAATAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTAATAGGACAAATTTCGTTGACAGTCTTATATTATTGGTGTATAATGTTTTTATGAAATAAAATTTCCATAAAAGGAGCTGAAGATTTTA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif AAYAGGACAAATTTTCAACTT

StartP-valueSite
9701.10e-12TTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTAATAGGACAA
9271.10e-12TTCAACTTAAAACAGGACAAATTTTCAACTTAATAGGACAA
9485.10e-12TTTTCAACTTAATAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACA
9045.10e-12TTTTCAAGATAATAGGACAAATTTTCAACTTAAAACAGGAC
8831.94e-11ACAAAAAGATAATAGGACAAATTTTCAAGATAATAGGACAA

Motif TTCMWKCAAHGG

StartP-valueSite
4003.25e-08TGTCGTTTTGTTCAAGCAACGGATACTGTGTT
4901.06e-07TAACTGTCGTTTCCTCCAAAGGAGGTGAAAGA
1171.06e-06TATTACTTTATTCCTTCAACAGTATACACCTG
5141.36e-06GTGAAAGATGTTCAAGGAATGGATACTATTGA
10541.49e-06GAAATAAAATTTCCATAAAAGGAGCTGAAGAT

Motif ATGTTTAAAATCAATTTTADGWCWTTY

StartP-valueSite
2613.98e-12TATCGTTAAAATGTTTAAAATCATTTTTAGGACTATCCTAGAACTTT
2022.43e-11TTTATAAAAAATCTCTAAAATCAATTTTAAGGCTTTTTATTTTATTG
7238.89e-11TTTTTACCGAAAGTTGAAAATCCACTTTCGGTAATTTTTTTAATTTT
4253.58e-10CTGTGTTGCTATGTTTCAAATTAATTATATCACATTCAATTTTTAAT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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pORI00000143 90.591 372 9 7 733 1079 4 374 0.0 470
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pORI00000143 94.915 59 2 1 947 1004 153 211 2.87e-19 92
pORI00000657 87.009 331 37 5 350 678 343 669 0.0 368