RefSeq NC_004974
DoriC accession number pORI00000143
OriC length 506 nt
OriC AT content 0.7866
The location of oriC region 4002..4507 nt
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OriC map
OriC sequences
TTTTCCACTTTCGGTAATTTTTTATATTTTTTTATTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAAATCACATTACTAATATGATTAATATAATAATATTATATAATAATATATAATACAGCACTCATTTTTCTTTTTAATAGCAATGTAAAACAAAAAGATAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTCATTGACAGTCTTATATTATTGGTGTATAATGTTTTTATGAAATAAAATTTCCATAAAAGGAGCTGAAGATTTTAGTGAATAATGATTTAGTAAAAGTACATAAAGATTTTACCAAATTAAATATAGGGACATTAAGTGAAAAAGAATTAGAATTATTTTATTATATATGTTTAAATGTAAAGGATATTAGAGATGAAATTATAACA
TTTTCCACTTTCGGTAATTTTTTATATTTTTTTATTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAAATCACATTACTAATATGATTAATATAATAATATTATATAATAATATATAATACAGCACTCATTTTTCTTTTTAATAGCAATGTAAAACAAAAAGATAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAAATTTCATTGACAGTCTTATATTATTGGTGTATAATGTTTTTATGAAATAAAATTTCCATAAAAGGAGCTGAAGATTTTAGTGAATAATGATTTAGTAAAAGTACATAAAGATTTTACCAAATTAAATATAGGGACATTAAGTGAAAAAGAATTAGAATTATTTTATTATATATGTTTAAATGTAAAGGATATTAGAGATGAAATTATAACA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif ACAGGACAAATTTTCAACTTT

StartP-valueSite
2651.28e-12TTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAA
2431.28e-12TTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAA
2211.28e-12TTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAA
1991.28e-12TTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAA
1771.28e-12TTCAACTTTAACAGGACAAATTTTCAACTTTAACAGGACAA

Motif CAGSAC

StartP-valueSite
2882.33e-05TCAACTTTAACAGGACAAATTTCATT
1562.33e-05AAAAAGATAACAGGACAAATTTTCAA
1104.58e-05ATATATAATACAGCACTCATTTTTCT

Motif GAGMTK

StartP-valueSite
3602.17e-05TCCATAAAAGGAGCTGAAGATTTTAG
379.48e-05TTTTTTTATTGAGCTTCTTTTATTAA
4901.79e-04AAGGATATTAGAGATGAAATTATAAC
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000143 100.0 506 0 0 1 506 1 506 0.0 935
pORI00000143 100.0 103 0 0 197 299 153 255 0.0 191
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pORI00000143 100.0 81 0 0 219 299 153 233 2.15e-37 150
pORI00000143 100.0 81 0 0 153 233 219 299 2.15e-37 150
pORI00000143 100.0 59 0 0 241 299 153 211 3.64e-25 110
pORI00000143 100.0 59 0 0 153 211 241 299 3.64e-25 110
pORI00000143 100.0 37 0 0 263 299 153 189 6.19e-13 69
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pORI00000141 96.832 505 11 5 4 506 1382 1883 0.0 839
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pORI00000141 92.308 104 5 3 197 299 1531 1632 9.99e-36 145
pORI00000141 92.683 82 4 2 153 233 1596 1676 2.18e-27 117
pORI00000768 90.591 372 9 7 4 374 733 1079 0.0 470
pORI00000768 95.0 80 2 2 154 233 927 1004 1.3e-29 124
pORI00000768 94.915 59 2 1 153 211 947 1004 1.32e-19 92