RefSeq NC_025132
DoriC accession number pORI00000622
OriC length 662 nt
OriC AT content 0.5529
The location of oriC region 6368..7029 nt
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OriC map
OriC sequences
ACAGAATCACCTCAAGAAGTATTATATATTAAAAGGAGAACAATTTTGTCTCCTTTTAATTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATTAGTCGATTCAAGGCCTTGGTTGAGGCATTCTTGCTTCCCTAAGTACTTAAAGTATTTAAAAGTATTTAGAAGTATATATAGCGCGCGAGGCTTGCGTTTGTGTTTTGCTTGTTCATAACCACAAAAGACCTTGGGGAGCCCCTCTCCCCAAATCCCATACCAACCCTTGGTCGCTTCGTTCCCTAAAAAGGTGTGGCTTCGCCACATTTAACTCCGGCTATGCCTGCGCGCCTTTGGCTTGCCCTAACGCGCTTCGCTTGCGTGGCTCAGAAGAGCCTCAGCTGAAGCTTCGGCAGGGCTAGCGCCATTCACCGACAAAAGCTCGTTGCCTAAATTTGATCAATCACTAATGCTTTTCATTGGTGCCATGAACATATGCTGATAAAAACGGCTTAGAACGCTTATATTTGCGTTCTAAGCCGTTTTTGATGTAAAGAGCATTAATTGTACCCGTCAGAGTAAGAAACGCTAGCACGGGCTCTTTAGTGCTTTTTAAAAC
ACAGAATCACCTCAAGAAGTATTATATATTAAAAGGAGAACAATTTTGTCTCCTTTTAATTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATTAGTCGATTCAAGGCCTTGGTTGAGGCATTCTTGCTTCCCTAAGTACTTAAAGTATTTAAAAGTATTTAGAAGTATATATAGCGCGCGAGGCTTGCGTTTGTGTTTTGCTTGTTCATAACCACAAAAGACCTTGGGGAGCCCCTCTCCCCAAATCCCATACCAACCCTTGGTCGCTTCGTTCCCTAAAAAGGTGTGGCTTCGCCACATTTAACTCCGGCTATGCCTGCGCGCCTTTGGCTTGCCCTAACGCGCTTCGCTTGCGTGGCTCAGAAGAGCCTCAGCTGAAGCTTCGGCAGGGCTAGCGCCATTCACCGACAAAAGCTCGTTGCCTAAATTTGATCAATCACTAATGCTTTTCATTGGTGCCATGAACATATGCTGATAAAAACGGCTTAGAACGCTTATATTTGCGTTCTAAGCCGTTTTTGATGTAAAGAGCATTAATTGTACCCGTCAGAGTAAGAAACGCTAGCACGGGCTCTTTAGTGCTTTTTAAAAC
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CGTGTGCTTTTTACCCCCCTA

StartP-valueSite
1417.19e-13ACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATTAGTCGATT
1197.19e-13ACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTT
977.19e-13ACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTT
757.19e-13ACCCCCCTATCGTGTGCTTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTT
532.17e-11ATTTTGTCTCCTTTTAATTTTTACCCCCCTATCGTGTGCTT

Motif GCDABGCTWGCG

StartP-valueSite
2481.75e-07TATATAGCGCGCGAGGCTTGCGTTTGTGTTTT
4563.45e-07TGAAGCTTCGGCAGGGCTAGCGCCATTCACCG
4141.78e-06GCCCTAACGCGCTTCGCTTGCGTGGCTCAGAA
3803.01e-06TTTAACTCCGGCTATGCCTGCGCGCCTTTGGC
6265.15e-06GTCAGAGTAAGAAACGCTAGCACGGGCTCTTT

Motif CSAYAMAAGVCCTTGG

StartP-valueSite
2822.90e-09TTGTTCATAACCACAAAAGACCTTGGGGAGCCCCTC
1671.85e-08CCCTATTAGTCGATTCAAGGCCTTGGTTGAGGCATT
3185.06e-08TCCCCAAATCCCATACCAACCCTTGGTCGCTTCGTT
4767.40e-08CGCCATTCACCGACAAAAGCTCGTTGCCTAAATTTG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000622 100.0 662 0 0 1 662 1 662 0.0 1223
pORI00000441 87.785 483 35 8 181 660 187 648 0.0 544
pORI00000489 90.4 375 34 2 288 661 375 2 0.0 492
pORI00000367 90.4 375 34 2 288 661 375 2 0.0 492