RefSeq NC_001757
DoriC accession number pORI00000251
OriC length 1359 nt
OriC AT content 0.6049
The location of oriC region 1..1359 nt
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OriC map
OriC sequences
GTCGACAACAGTTGTTAATCATGACGGCTTTTCTAAGGGGTTAGGGCTTCAAGTACTCAACCGGAAAACCGTGTAGTTCCTTTTATGGCGCCGTTTATCGAAGACTTCGGGGGCTAGAAAATGAAATCAAGTTCGATTTATTTTGACCGATTTTTTTCTCTTTCGTGGCGATTTTTTAATTGGCTGGAACTTATTTTCTTAGCTTTTCTGCTTGGCTGTGTTGGCTTGTTTGCCGAAAAAATTAATGTTTTTTTCAGCCCAAAATTTCCTCAATATTTCAATATTTGGGCCGATTTCTGGCAGGCTGGAGAAAAATTAATCGGATGTAGCAAGAAGTTAGTTATCGTTTTATTGGTTGATTATTTTGTGATTTTTTTGGTTGCAAAAATAGTTGGAATAAAAATTATTCGGTCTAGTCGTTTATCTAGCAACCTGCGTCAAATGCTGTTAACAACAGTCGATCGGATACCATCGACCGATCAAAATAAACGAGATAAAGCGAAAAATATTAGTGCGGAAAAGGCTAATAAAGCCGTCAGAAAATCTTTTGTGATTGCTAAGTGGGACTCAATTTTGGCTGTGGTAAAAATTCCAAAGCAGATAGAAACTAGAAAATTGCTGATTGATTATCTCAATGATGTCGCTGATGATTTGAGTGGTCAAACTGGAATGACTTCCTCGGCGTGGCAGACGTTTCTAACGGACTAACTTTTTCTAATTATCGAGTTATGGAATTCAGAAAATAAAAAAGCATTGAAGCAGTGCGCTCGCTTTGTCGCAAGACAAGGAGCGGAGCGCACTGCTTCAATGCATATTCTGATTAATCTTGTTGCCGTGTTGCAGATAGTAGACTGGTGCGAAGCCCGCTGTTAGTAGGTGAGTGTCAAGCGACACAACGCCTGGAGCGTGAGCGGAAGGGCAGCGCTTGACATGGTGAGACGGGAAGACCCTAGTTGAGCGAAAGCGAGAAAAAAGTCATTTTTTCCGCTTTAGCCCGCCCGGCGAGGGGAAATGCGGTCCAGCTGGGTCAGGGTTTTAGGGGGTGAAACATCCTTAGAAACTCGCTGTAAGCGAGTTTCTTCTTATCTTGATACATATAGAAACAACGCCATTTTTTGAAATTGGGTTAAACCCTTGATATGACTGGGTTTATTAGGATTTTAAAATATAACACTTTTTGGTGTATAATAAGCATTGTAAGAATTAAATAAAAAACTCATGCAGTTGTTCGATTTGGCCGTCGATGCATCAGTTAGTTATCGTTATTAACTTCGAACCCTATTATAATATGTCATTAGGAATATATCAATGATAACTAACTCTGACTGCTTGTAGTTTTTGCAGTTAGAGGTATAAGAA
GTCGACAACAGTTGTTAATCATGACGGCTTTTCTAAGGGGTTAGGGCTTCAAGTACTCAACCGGAAAACCGTGTAGTTCCTTTTATGGCGCCGTTTATCGAAGACTTCGGGGGCTAGAAAATGAAATCAAGTTCGATTTATTTTGACCGATTTTTTTCTCTTTCGTGGCGATTTTTTAATTGGCTGGAACTTATTTTCTTAGCTTTTCTGCTTGGCTGTGTTGGCTTGTTTGCCGAAAAAATTAATGTTTTTTTCAGCCCAAAATTTCCTCAATATTTCAATATTTGGGCCGATTTCTGGCAGGCTGGAGAAAAATTAATCGGATGTAGCAAGAAGTTAGTTATCGTTTTATTGGTTGATTATTTTGTGATTTTTTTGGTTGCAAAAATAGTTGGAATAAAAATTATTCGGTCTAGTCGTTTATCTAGCAACCTGCGTCAAATGCTGTTAACAACAGTCGATCGGATACCATCGACCGATCAAAATAAACGAGATAAAGCGAAAAATATTAGTGCGGAAAAGGCTAATAAAGCCGTCAGAAAATCTTTTGTGATTGCTAAGTGGGACTCAATTTTGGCTGTGGTAAAAATTCCAAAGCAGATAGAAACTAGAAAATTGCTGATTGATTATCTCAATGATGTCGCTGATGATTTGAGTGGTCAAACTGGAATGACTTCCTCGGCGTGGCAGACGTTTCTAACGGACTAACTTTTTCTAATTATCGAGTTATGGAATTCAGAAAATAAAAAAGCATTGAAGCAGTGCGCTCGCTTTGTCGCAAGACAAGGAGCGGAGCGCACTGCTTCAATGCATATTCTGATTAATCTTGTTGCCGTGTTGCAGATAGTAGACTGGTGCGAAGCCCGCTGTTAGTAGGTGAGTGTCAAGCGACACAACGCCTGGAGCGTGAGCGGAAGGGCAGCGCTTGACATGGTGAGACGGGAAGACCCTAGTTGAGCGAAAGCGAGAAAAAAGTCATTTTTTCCGCTTTAGCCCGCCCGGCGAGGGGAAATGCGGTCCAGCTGGGTCAGGGTTTTAGGGGGTGAAACATCCTTAGAAACTCGCTGTAAGCGAGTTTCTTCTTATCTTGATACATATAGAAACAACGCCATTTTTTGAAATTGGGTTAAACCCTTGATATGACTGGGTTTATTAGGATTTTAAAATATAACACTTTTTGGTGTATAATAAGCATTGTAAGAATTAAATAAAAAACTCATGCAGTTGTTCGATTTGGCCGTCGATGCATCAGTTAGTTATCGTTATTAACTTCGAACCCTATTATAATATGTCATTAGGAATATATCAATGATAACTAACTCTGACTGCTTGTAGTTTTTGCAGTTAGAGGTATAAGAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CGCNHGACAAGGNGHGRHGCG

StartP-valueSite
7775.70e-12CTCGCTTTGTCGCAAGACAAGGAGCGGAGCGCACTGCTTCA
9961.50e-09CGCTTTAGCCCGCCCGGCGAGGGGAAATGCGGTCCAGCTGG
9232.31e-09GGAAGGGCAGCGCTTGACATGGTGAGACGGGAAGACCCTAG
8872.47e-09GTGAGTGTCAAGCGACACAACGCCTGGAGCGTGAGCGGAAG

Motif AAAATTAAATMAANATYKMADBADTTBGNYCGATTT

StartP-valueSite
1188.83e-15CGGGGGCTAGAAAATGAAATCAAGTTCGATTTATTTTGACCGATTTTTTTCTCTTT
2612.46e-14TTTTCAGCCCAAAATTTCCTCAATATTTCAATATTTGGGCCGATTTCTGGCAGGCT
12002.10e-13AAGCATTGTAAGAATTAAATAAAAAACTCATGCAGTTGTTCGATTTGGCCGTCGAT
7397.15e-13ATGGAATTCAGAAAATAAAAAAGCATTGAAGCAGTGCGCTCGCTTTGTCGCAAGAC

Motif GCCGTC

StartP-valueSite
12377.48e-05GTTCGATTTGGCCGTCGATGCATCAG
5327.48e-05GGCTAATAAAGCCGTCAGAAAATCTT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000251 100.0 1359 0 0 1 1359 1 1359 0.0 2510
pORI00000280 92.683 41 2 1 1077 1116 653 693 3.68e-09 58
pORI00000151 100.0 29 0 0 1075 1103 43 71 4.76e-08 55