RefSeq NC_010939.1
Accession number NC_010939.1
DoriC accession number ORI92530222
OriC length 470 nt
OriC AT content 0.72766
The location of oriC region 1909969..1910438 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif RTTATCMRSAGAT

StartP-valueSite
3029.27e-08AAATCTAATAGTTATCCACAGGTGAAGCATTTT
3751.58e-07AATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTA
3521.01e-06TAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGA
2663.18e-06AAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTG
4547.02e-06TTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT

Motif GATCSK

StartP-valueSite
1194.65e-05TCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTA
1074.65e-05TCGTTTATTCGATCCGAAAGAAGATC
1872.50e-04TTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGA
1272.96e-04AAGATCCGATGATCGCTAATTATCAT
954.24e-04GCAATTTTAAGATCGTTTATTCGATC

Motif TCTRCCT

StartP-valueSite
41.28e-05ATATCTGCCTTTATAATTTT
554.54e-05AGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI92530222 100.0 470 0 0 1 470 1 470 0.0 869
ORI92230190 99.149 470 4 0 1 470 1 470 0.0 846
ORI80030140 99.109 449 4 0 1 449 1 449 0.0 808