RefSeq NC_009053.1
Accession number NC_009053.1
DoriC accession number ORI80030140
OriC length 449 nt
OriC AT content 0.734967
The location of oriC region 1883252..1883700 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif RTTWTCHRCAGAT

StartP-valueSite
3021.72e-07AAATCTAATAGTTATCCACAGGTGAAGCATTTT
3752.84e-07AATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTA
2661.19e-06AAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTG
3521.59e-06TAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGA
3981.68e-05AAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACA

Motif GATCCK

StartP-valueSite
1194.23e-05TCCGAAAGAAGATCCGATGATTGCTA
1074.23e-05TCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATC
1871.47e-04TTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGA
953.11e-04GCAATTTTAAGATCGTTTATACGATC

Motif TCTRCCT

StartP-valueSite
41.20e-05ATATCTGCCTTTATAATTTT
554.46e-05AGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI80030140 100.0 449 0 0 1 449 1 449 0.0 830
ORI92230190 99.555 449 2 0 1 449 1 449 0.0 819
ORI92530222 99.109 449 4 0 1 449 1 449 0.0 808