RefSeq NC_010278.1
Accession number NC_010278.1
DoriC accession number ORI92230190
OriC length 470 nt
OriC AT content 0.734043
The location of oriC region 1846236..1846705 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidaATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
gidAATATCTGCCTTTATAATTTTTATATTCTGAGTAACTGAAACAAAAGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACAGGATCATGAAAACGCAATTTTAAGATCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTAATTATAATATAGATCTATATATAGAGATCTTTATTATTGTTATTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGATAACTCTATATTTTTAAATAAAATCAAAAAGTTAGCGTAACTTAAAATCGATAAAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTGGATAAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTTATCAAGTTATTAATGAATAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTAATTTTATGCTGATTTAATAAACAAAACGGCGTAATATAAAGCGTATTTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT-
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif RTTATCMRSAGAT

StartP-valueSite
3023.84e-08AAATCTAATAGTTATCCACAGATGAAGCATTTT
3751.29e-07AATCTACTGAATTATCCACAGATAAAATAATTA
3526.03e-07TAGATCTCAAGTTGTCAGGCGATAATCTACTGA
2662.42e-06AAGATCTTGTATTTTCAACAGATCTAATTTGTG
4545.25e-06TTAAGAATGAATAATTCGGAGATGATT

Motif GATCSK

StartP-valueSite
1194.20e-05TCCGAAAGAAGATCCGATGATCGCTA
1074.20e-05TCGTTTATACGATCCGAAAGAAGATC
1872.28e-04TTATTAGAGAGATCCTTTTATGAGGA
1272.70e-04AAGATCCGATGATCGCTAATTATAAT
953.88e-04GCAATTTTAAGATCGTTTATACGATC

Motif TCTRCCT

StartP-valueSite
41.13e-05ATATCTGCCTTTATAATTTT
554.18e-05AGAGTGCTATTCTACCTCAAAATTACA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI92230190 100.0 470 0 0 1 470 1 470 0.0 869
ORI92530222 99.149 470 4 0 1 470 1 470 0.0 846
ORI80030140 99.555 449 2 0 1 449 1 449 0.0 819