RefSeq NC_008700.1
Accession number NC_008700.1
DoriC accession number ORI70020038
OriC length 445 nt
OriC AT content 0.629214
The location of oriC region 4305767..69 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GATCKC

StartP-valueSite
2731.13e-04GGTGGGGATAGATCGCCATTTTATCC
1661.13e-04CTCTTATTAGGATCGCACTTATCTGT
281.13e-04AGAAAACAAAGATCGCATAACGAGCC
2352.76e-04CTGATCCTGTGATCTCAAGGCGATCT
1392.76e-04TCTTTATATAGATCTCTTTATTGTTA

Motif ATCCAMA

StartP-valueSite
3584.21e-05ATCATATATTATCCACATATTATTTAT
2854.21e-05TCGCCATTTTATCCACAGGGTGGATCT
2171.27e-04ACAGATAATAATCCAAATCTGATCCTG
971.27e-04GCATGTAAAGATCCAAAGGGGATCGGC

Motif GGTRWYTKAGBAWWRCMWSRG

StartP-valueSite
3135.22e-11TGACCTTATAGGTGTTTGAGTAATGCAACGGTAGATCAGAT
4151.45e-10CTAAGTTGTGGGTGACTGAGGATAACCTCGGATGTTCGATC
453.25e-10TAACGAGCCGGGTATTTTAGCATTGCCAGAGACAGAGTTGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI70020038 100.0 445 0 0 1 445 1 445 0.0 822
ORI97017021 73.743 358 71 21 70 416 70 415 6.83e-28 119
ORI96000422 83.824 68 6 3 125 187 109 176 4.2e-10 60
ORI93020099 83.824 68 6 3 125 187 109 176 4.2e-10 60
ORI92720076 83.824 68 6 3 125 187 109 176 4.2e-10 60
ORI10020005 83.824 68 6 3 125 187 109 176 4.2e-10 60
ORI10020004 83.824 68 6 3 125 187 109 176 4.2e-10 60