RefSeq NC_009901.1
Accession number NC_009901.1
DoriC accession number ORI97017021
OriC length 457 nt
OriC AT content 0.649891
The location of oriC region 5165130..5165586 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CGYTGADMDGATC

StartP-valueSite
3316.41e-08TTAATACAGACGTTGATCAGATCAAAATAATAG
2992.47e-07CAAGGTGGATCATTGAGCAGATCGGGTGTGAAT
2177.61e-07CAAGGGTTAACGCCGAAATGATCTTGTGATCTA
352.79e-06GATAAATTGTTTCTGAGCGGATCATTTTAGCAT
4333.33e-06AAAGTTAAAGCGTTTATATGATCGAATATAAGA

Motif GATCTA

StartP-valueSite
4013.22e-04GGATAAGTTGGATCTAATCTGTGGGC
2453.22e-04ATCTAATTGCGATCTAACAGGCTTAA
2343.22e-04ATGATCTTGTGATCTAATTGCGATCT
973.22e-04TGCTTGTTTTGATCTAGGGCGATCGG
783.22e-04TAAGGTGAACGATCTATTTTGCTTGT

Motif CTTATCCACA

StartP-valueSite
3544.71e-07AAAATAATAGCTTATCCACATATTTATTAA
2814.71e-07AGATCGTGTACTTATCCACAAGGTGGATCA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI97017021 100.0 457 0 0 1 457 1 457 0.0 845
ORI70020038 73.669 357 73 19 70 415 70 416 7.03e-28 119