RefSeq NC_017274.1
DoriC accession number aORI10010109
OriC length 837 nt
OriC AT content 0.7085
The location of oriC region 1344..2180 nt
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OriC map
OriC sequences
ATTTTACAGTAAATTTCCTACGTTTCTATAACACTTTCGTACCCTAATCTCTCAATACAATTGTCTCTGTGTAAATTTCCTACGTTTCATCTGAAAATCTAGCTATTAGAGCTTGGTTTAATTATACAAACTCAATATTTTTCTTTTTTCCTTCCTTTAATGTTTCAGATGAAATTAAGAGAGTGTCTCTTTAAAAACGATAATACTTTATACAAACGTACTACTTTTGGCGGTATATAGGGTATTTTTAAGGATGAAATCACAGGAAATTTACTGCATAACTGGGGAGTTAAATTTTTCCGATAATTATAATATTTCAGAAAAAAGAATTTAAAGTCCAATATTTGCTTCACTATGGTTACATTACCTTGTAATAAGGAAAAACTATTTTTAGATTCTAGACTTTTAAGTTTCTAACAATTATGAAAAGATTAATAAGTTAATTCTTGAAGGTAGGTTTGTGGCAATGGTTATTAGACGTACGTTTATAAAGTCTACCTTAGCAGTGTCCTTTTCAATATCGTATTTACTATACCTTATTGCTAGGGCATCTTTTGGATCGGGTAAACTAGCCTTTGTTATAGCATTGTTACAATTGTATCCTTACTTTCTAATTGAGTACTTGCCTACAGGGCAAGTTATTTCATTGTTCTTCCAATCTCTTTTATTGCTTCTTTTTGCGATTTTCGTTTTATTGATTACATATATCTTATTTTCATTCTATAAATTATACAAAATGATTAAAACCTCAGTTTTGAAGTAATATTGATTTAACCTGTGGTCTAGATATTACCAACAAAGTCATAGGAAACAGGTTTAACAGCAGAAACATTAGAA
ATTTTACAGTAAATTTCCTACGTTTCTATAACACTTTCGTACCCTAATCTCTCAATACAATTGTCTCTGTGTAAATTTCCTACGTTTCATCTGAAAATCTAGCTATTAGAGCTTGGTTTAATTATACAAACTCAATATTTTTCTTTTTTCCTTCCTTTAATGTTTCAGATGAAATTAAGAGAGTGTCTCTTTAAAAACGATAATACTTTATACAAACGTACTACTTTTGGCGGTATATAGGGTATTTTTAAGGATGAAATCACAGGAAATTTACTGCATAACTGGGGAGTTAAATTTTTCCGATAATTATAATATTTCAGAAAAAAGAATTTAAAGTCCAATATTTGCTTCACTATGGTTACATTACCTTGTAATAAGGAAAAACTATTTTTAGATTCTAGACTTTTAAGTTTCTAACAATTATGAAAAGATTAATAAGTTAATTCTTGAAGGTAGGTTTGTGGCAATGGTTATTAGACGTACGTTTATAAAGTCTACCTTAGCAGTGTCCTTTTCAATATCGTATTTACTATACCTTATTGCTAGGGCATCTTTTGGATCGGGTAAACTAGCCTTTGTTATAGCATTGTTACAATTGTATCCTTACTTTCTAATTGAGTACTTGCCTACAGGGCAAGTTATTTCATTGTTCTTCCAATCTCTTTTATTGCTTCTTTTTGCGATTTTCGTTTTATTGATTACATATATCTTATTTTCATTCTATAAATTATACAAAATGATTAAAACCTCAGTTTTGAAGTAATATTGATTTAACCTGTGGTCTAGATATTACCAACAAAGTCATAGGAAACAGGTTTAACAGCAGAAACATTAGAA
ATTTTACAGTAAATTTCCTACGTTTCTATAACACTTTCGTACCCTAATCTCTCAATACAATTGTCTCTGTGTAAATTTCCTACGTTTCATCTGAAAATCTAGCTATTAGAGCTTGGTTTAATTATACAAACTCAATATTTTTCTTTTTTCCTTCCTTTAATGTTTCAGATGAAATTAAGAGAGTGTCTCTTTAAAAACGATAATACTTTATACAAACGTACTACTTTTGGCGGTATATAGGGTATTTTTAAGGATGAAATCACAGGAAATTTACTGCATAACTGGGGAGTTAAATTTTTCCGATAATTATAATATTTCAGAAAAAAGAATTTAAAGTCCAATATTTGCTTCACTATGGTTACATTACCTTGTAATAAGGAAAAACTATTTTTAGATTCTAGACTTTTAAGTTTCTAACAATTATGAAAAGATTAATAAGTTAATTCTTGAAGGTAGGTTTGTGGCAATGGTTATTAGACGTACGTTTATAAAGTCTACCTTAGCAGTGTCCTTTTCAATATCGTATTTACTATACCTTATTGCTAGGGCATCTTTTGGATCGGGTAAACTAGCCTTTGTTATAGCATTGTTACAATTGTATCCTTACTTTCTAATTGAGTACTTGCCTACAGGGCAAGTTATTTCATTGTTCTTCCAATCTCTTTTATTGCTTCTTTTTGCGATTTTCGTTTTATTGATTACATATATCTTATTTTCATTCTATAAATTATACAAAATGATTAAAACCTCAGTTTTGAAGTAATATTGATTTAACCTGTGGTCTAGATATTACCAACAAAGTCATAGGAAACAGGTTTAACAGCAGAAACATTAGAA
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif SAGKAAATTTMCTRCGTWTC

StartP-valueSite
77.62e-11ATTTTACAGTAAATTTCCTACGTTTCTATAACACTT
694.80e-10AATTGTCTCTGTGTAAATTTCCTACGTTTCATCTGAAAAT
2631.39e-09GATGAAATCACAGGAAATTTACTGCATAACTGGGGAGTTA
1681.72e-08TAATGTTTCAGATGAAATTAAGAGAGTGTCTCTTTAAAAA

Motif AGGGCA

StartP-valueSite
6314.15e-05ACTTGCCTACAGGGCAAGTTATTTCA
5454.15e-05CCTTATTGCTAGGGCATCTTTTGGAT

Motif AGTTATTRGAVVTAGGTTTA

StartP-valueSite
4691.42e-09TTGTGGCAATGGTTATTAGACGTACGTTTATAAAGTCTAC
1011.42e-09CTGAAAATCTAGCTATTAGAGCTTGGTTTAATTATACAAA
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4426.69e-09TTAATAAGTTAATTCTTGAAGGTAGGTTTGTGGCAATGGT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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aORI10010336 100.0 466 0 0 1 466 1 466 0.0 861
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aORI10010067 86.534 453 60 1 386 837 1 453 0.0 497
aORI10010361 100.0 74 0 0 764 837 1 74 8.17e-34 137