RefSeq NZ_CP011055.1
DoriC accession number aORI10010330
OriC length 466 nt
OriC AT content 0.279
The location of oriC region 1376..1841 nt
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OriC map
OriC sequences
ATTTTACAGTAAATTTCCTACGTTTCTATAACACTTTCGTACCCTAATCTCTCAATACAATTGTCTCTGTGTAAATTTCCTACGTTTCATCTGAAAATCTAGCTATTAGAGCTTGGTTTAATTATACAAACTCAATATTTTTCTTTTTTCCTTCCTTTAATGTTTCAGATGAAATTAAGAGAGTGTCTCTTTAAAAACGATAATACTTTATACAAACGTACTACTTTTGGCGGTATATAGGGTATTTTTAAGGATGAAATCACAGGAAATTTACTGCATAACTGGGGAGTTAAATTTTTCCGATAATTATAATATTTCAGAAAAAAGAATTTAAAGTCCAATATTTGCTTCACTATGGTTACATTACCTTGTAATAAGGAAAAACTATTTTTAGATTCTAGACTTTTAAGTTTCTAACAATTATGAAAAGATTAATAAGTTAATTCTTGAAGGTAGGTTTGTGGCA
ATTTTACAGTAAATTTCCTACGTTTCTATAACACTTTCGTACCCTAATCTCTCAATACAATTGTCTCTGTGTAAATTTCCTACGTTTCATCTGAAAATCTAGCTATTAGAGCTTGGTTTAATTATACAAACTCAATATTTTTCTTTTTTCCTTCCTTTAATGTTTCAGATGAAATTAAGAGAGTGTCTCTTTAAAAACGATAATACTTTATACAAACGTACTACTTTTGGCGGTATATAGGGTATTTTTAAGGATGAAATCACAGGAAATTTACTGCATAACTGGGGAGTTAAATTTTTCCGATAATTATAATATTTCAGAAAAAAGAATTTAAAGTCCAATATTTGCTTCACTATGGTTACATTACCTTGTAATAAGGAAAAACTATTTTTAGATTCTAGACTTTTAAGTTTCTAACAATTATGAAAAGATTAATAAGTTAATTCTTGAAGGTAGGTTTGTGGCA
ATTTTACAGTAAATTTCCTACGTTTCTATAACACTTTCGTACCCTAATCTCTCAATACAATTGTCTCTGTGTAAATTTCCTACGTTTCATCTGAAAATCTAGCTATTAGAGCTTGGTTTAATTATACAAACTCAATATTTTTCTTTTTTCCTTCCTTTAATGTTTCAGATGAAATTAAGAGAGTGTCTCTTTAAAAACGATAATACTTTATACAAACGTACTACTTTTGGCGGTATATAGGGTATTTTTAAGGATGAAATCACAGGAAATTTACTGCATAACTGGGGAGTTAAATTTTTCCGATAATTATAATATTTCAGAAAAAAGAATTTAAAGTCCAATATTTGCTTCACTATGGTTACATTACCTTGTAATAAGGAAAAACTATTTTTAGATTCTAGACTTTTAAGTTTCTAACAATTATGAAAAGATTAATAAGTTAATTCTTGAAGGTAGGTTTGTGGCA
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif TCASAGKAAATTTMCTRCGTWTC

StartP-valueSite
42.85e-11ATTTTACAGTAAATTTCCTACGTTTCTATAACACTT
2603.89e-11AAGGATGAAATCACAGGAAATTTACTGCATAACTGGGGAGTTA
664.23e-11TACAATTGTCTCTGTGTAAATTTCCTACGTTTCATCTGAAAAT
1657.66e-10CTTTAATGTTTCAGATGAAATTAAGAGAGTGTCTCTTTAAAAA

Motif TGGSGR

StartP-valueSite
2283.94e-05GTACTACTTTTGGCGGTATATAGGGT
2831.34e-04ACTGCATAACTGGGGAGTTAAATTTT

Motif AGSTWGG

StartP-valueSite
4513.15e-05TAATTCTTGAAGGTAGGTTTGTGGCA
1106.82e-05TAGCTATTAGAGCTTGGTTTAATTATA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010336 100.0 466 0 0 1 466 1 466 0.0 861
aORI10010333 100.0 466 0 0 1 466 1 466 0.0 861
aORI10010330 100.0 466 0 0 1 466 1 466 0.0 861
aORI10010109 100.0 466 0 0 1 466 1 466 0.0 861
aORI10010011 100.0 466 0 0 1 466 1 466 0.0 861