RefSeq NC_009637.1
DoriC accession number aORI10010048
OriC length 609 nt
OriC AT content 0.8637
The location of oriC region 1005691..1006299 nt
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OriC map
OriC sequences
ATTACCCCTAATTTTAAATAATCAGTTTTTTTGTTTTTATTTTGTTTTTTTAAAAGTTAAAAACTGTAAAAATAAAATTTTAATTTTATATTCACAGTATTTTATTTTGTTATTTTAATTCATATGTGGTATTAATTAAAAAATTAATCTTATTACAATATTTTATTATTTAAACAATATTTTAAACCTATTTTTGCTGGAATATCATACTTTTCATTTAATATATTATTTAAATAATAAAAAACTGTTTTAATATATATTATTTATTATATTCACAATTTTTACTGATTTTAATTTTATATTCACAATTAATATTTACAAAAATACCATATTTTTTGTAATTAAAATTTAATTTATGATTATTGTGATATATTTATATAATAAGTTAATATTATTAAAATAATTTTTAATTAAAAACAAAGATTTATTTCTAATATTTTATTAAAAAAATATTATATTCACAATTTTTACCGATTTTAATTTTATATTCACAATTTATTTATTTTCAAAACTTTAAACTTTCGGTTTTTCGAAACATATAAAAAAGATAATATATTATATAATTTAGGAAACTTTTCGGACTATTTTCATATTGGAGGGATATGGCTT
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ATTACCCCTAATTTTAAATAATCAGTTTTTTTGTTTTTATTTTGTTTTTTTAAAAGTTAAAAACTGTAAAAATAAAATTTTAATTTTATATTCACAGTATTTTATTTTGTTATTTTAATTCATATGTGGTATTAATTAAAAAATTAATCTTATTACAATATTTTATTATTTAAACAATATTTTAAACCTATTTTTGCTGGAATATCATACTTTTCATTTAATATATTATTTAAATAATAAAAAACTGTTTTAATATATATTATTTATTATATTCACAATTTTTACTGATTTTAATTTTATATTCACAATTAATATTTACAAAAATACCATATTTTTTGTAATTAAAATTTAATTTATGATTATTGTGATATATTTATATAATAAGTTAATATTATTAAAATAATTTTTAATTAAAAACAAAGATTTATTTCTAATATTTTATTAAAAAAATATTATATTCACAATTTTTACCGATTTTAATTTTATATTCACAATTTATTTATTTTCAAAACTTTAAACTTTCGGTTTTTCGAAACATATAAAAAAGATAATATATTATATAATTTAGGAAACTTTTCGGACTATTTTCATATTGGAGGGATATGGCTT
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif TTATATTCACAAT

StartP-valueSite
869.50e-08AATTTTAATTTTATATTCACAGTATTTTATTTT
4836.80e-07GATTTTAATTTTATATTCACAATTTATTTATTT
4536.80e-07TAAAAAAATATTATATTCACAATTTTTACCGAT
2976.80e-07GATTTTAATTTTATATTCACAATTAATATTTAC
2676.80e-07ATATTATTTATTATATTCACAATTTTTACTGAT

Motif GSWRRVWTWTSRB

StartP-valueSite
5952.71e-11TTTTCATATTGGAGGGATATGGCTT
5681.31e-07ATATAATTTAGGAAACTTTTCGGACTATTTTCA
1963.26e-07ACCTATTTTTGCTGGAATATCATACTTTTCATT

Motif TACCSM

StartP-valueSite
31.15e-05ATTACCCCTAATTTTAAA
4693.70e-05TCACAATTTTTACCGATTTTAATTTT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010048 100.0 609 0 0 1 609 1 609 0.0 1125
aORI10010041 82.594 609 99 7 3 607 608 3 0.0 531
aORI10010052 81.759 614 99 9 3 609 608 1 0.0 501