RefSeq | NC_000909.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 687 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.7962 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 694540..695226 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
ATTTACACCCAGTATTCCTAATAACTATTATTGTTGTGATTTTGTTTTGTTGATACTCAATTATATTTGACATACTCGTTTATAAAACTTTTGATTCATGGGATTGTTTTAACCCCTATGTGTTGGGTGTAGTAATACTAACATTTTAAGAACGTCTCTTTGAGTATGTTTCTATATTGTACCAATATTTATCTCTTTCTATTATTTTGTTGTTATATGCTATTTTTTACTAATAATTCTTAGATTTAATATACTGTTAATTTACATATAATCTTTGATTCATAGTTTTTTATTGGTTATATTATTTGATTCACGATATCTTATTTTTAATATTTTGAAGCAATTCCTATGAGAAGAATTAAAATTAACTTTATTTCATTAGAATAATATATATATTATATTTAATTTCATTCAAGTTTATTTCTGAAAATAATAATCACTTATTCTATATGAAATATTGTTTGATTCATTAGATTTTTTAATTTTATTGTTTGATTCATGAGATTTTTAATAAACTTTATAATAAAACATTTAAATTTAAGAATAATTGATTCAATCTATCTTTCGATTTTTCGAAATCTATATAACGTTCTTAAGACAAAAGTTCGAAATCAATGGAAAATATTGTAGATAATTAGTAGATAATTAATTTAAATAAATTAATTTATATTTTATTGCGGTGGAAAC
ATTTACACCCAGTATTCCTAATAACTATTATTGTTGTGATTTTGTTTTGTTGATACTCAATTATATTTGACATACTCGTTTATAAAACTTTTGATTCATGGGATTGTTTTAACCCCTATGTGTTGGGTGTAGTAATACTAACATTTTAAGAACGTCTCTTTGAGTATGTTTCTATATTGTACCAATATTTATCTCTTTCTATTATTTTGTTGTTATATGCTATTTTTTACTAATAATTCTTAGATTTAATATACTGTTAATTTACATATAATCTTTGATTCATAGTTTTTTATTGGTTATATTATTTGATTCACGATATCTTATTTTTAATATTTTGAAGCAATTCCTATGAGAAGAATTAAAATTAACTTTATTTCATTAGAATAATATATATATTATATTTAATTTCATTCAAGTTTATTTCTGAAAATAATAATCACTTATTCTATATGAAATATTGTTTGATTCATTAGATTTTTTAATTTTATTGTTTGATTCATGAGATTTTTAATAAACTTTATAATAAAACATTTAAATTTAAGAATAATTGATTCAATCTATCTTTCGATTTTTCGAAATCTATATAACGTTCTTAAGACAAAAGTTCGAAATCAATGGAAAATATTGTAGATAATTAGTAGATAATTAATTTAAATAAATTAATTTATATTTTATTGCGGTGGAAAC
ATTTACACCCAGTATTCCTAATAACTATTATTGTTGTGATTTTGTTTTGTTGATACTCAATTATATTTGACATACTCGTTTATAAAACTTTTGATTCATGGGATTGTTTTAACCCCTATGTGTTGGGTGTAGTAATACTAACATTTTAAGAACGTCTCTTTGAGTATGTTTCTATATTGTACCAATATTTATCTCTTTCTATTATTTTGTTGTTATATGCTATTTTTTACTAATAATTCTTAGATTTAATATACTGTTAATTTACATATAATCTTTGATTCATAGTTTTTTATTGGTTATATTATTTGATTCACGATATCTTATTTTTAATATTTTGAAGCAATTCCTATGAGAAGAATTAAAATTAACTTTATTTCATTAGAATAATATATATATTATATTTAATTTCATTCAAGTTTATTTCTGAAAATAATAATCACTTATTCTATATGAAATATTGTTTGATTCATTAGATTTTTTAATTTTATTGTTTGATTCATGAGATTTTTAATAAACTTTATAATAAAACATTTAAATTTAAGAATAATTGATTCAATCTATCTTTCGATTTTTCGAAATCTATATAACGTTCTTAAGACAAAAGTTCGAAATCAATGGAAAATATTGTAGATAATTAGTAGATAATTAATTTAAATAAATTAATTTATATTTTATTGCGGTGGAAAC
ORB
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif AWTNTTTGATTCATGRKATTTT
Motif AMMCCC
Motif CGAAATC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|