RefSeq NZ_CP029203
DoriC accession number pORI00001180
OriC length 228 nt
OriC AT content 0.8904
The location of oriC region 7415..7642 nt
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OriC map
OriC sequences
ATATATTTTTAAAATCAAATTATTAAAGGTATTTGAAAGAATATTGAATTTATGTTATATTTTAACTATTCTAGTTTTTTTTAAATATAAAAAAAGATTTTTTATATTAAAAAATTATTAAAAATTATTAAAATTAATTGTTATGTTGATTTAAATAATATTATTGAAAAATACAATTTTAATATTTGAATTTAACGAATATATTTTACCTACATCAAGTGTATTTTA
ATATATTTTTAAAATCAAATTATTAAAGGTATTTGAAAGAATATTGAATTTATGTTATATTTTAACTATTCTAGTTTTTTTTAAATATAAAAAAAGATTTTTTATATTAAAAAATTATTAAAAATTATTAAAATTAATTGTTATGTTGATTTAAATAATATTATTGAAAAATACAATTTTAATATTTGAATTTAACGAATATATTTTACCTACATCAAGTGTATTTTA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CSWAYATM

StartP-valueSite
2092.54e-07ATATATTTTACCTACATCAAGTGTATTT
1966.34e-05TTGAATTTAACGAATATATTTTACCTAC

Motif TMWAGK

StartP-valueSite
702.89e-04TTTTAACTATTCTAGTTTTTTTTAAA
244.80e-04ATCAAATTATTAAAGGTATTTGAAAG

Motif GAAARA

StartP-valueSite
351.79e-04AAAGGTATTTGAAAGAATATTGAATT
1661.22e-03TAATATTATTGAAAAATACAATTTTA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00001180 100.0 228 0 0 1 228 1 228 0.0 422
pORI00000356 99.561 228 0 1 1 228 1 227 0.0 414