RefSeq NC_001910
DoriC accession number pORI00000356
OriC length 227 nt
OriC AT content 0.8899
The location of oriC region 2141..2367 nt
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OriC map
OriC sequences
ATATATTTTTAAAATCAAATTATTAAAGGTATTTGAAAGAATATTGAATTTATGTTATATTTTAACTATTCTAGTTTTTTTAAATATAAAAAAAGATTTTTTATATTAAAAAATTATTAAAAATTATTAAAATTAATTGTTATGTTGATTTAAATAATATTATTGAAAAATACAATTTTAATATTTGAATTTAACGAATATATTTTACCTACATCAAGTGTATTTTA
ATATATTTTTAAAATCAAATTATTAAAGGTATTTGAAAGAATATTGAATTTATGTTATATTTTAACTATTCTAGTTTTTTTAAATATAAAAAAAGATTTTTTATATTAAAAAATTATTAAAAATTATTAAAATTAATTGTTATGTTGATTTAAATAATATTATTGAAAAATACAATTTTAATATTTGAATTTAACGAATATATTTTACCTACATCAAGTGTATTTTA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CSWAYATM

StartP-valueSite
2082.60e-07ATATATTTTACCTACATCAAGTGTATTT
1956.45e-05TTGAATTTAACGAATATATTTTACCTAC

Motif TMWAGK

StartP-valueSite
702.91e-04TTTTAACTATTCTAGTTTTTTTAAAT
244.85e-04ATCAAATTATTAAAGGTATTTGAAAG

Motif GAAARA

StartP-valueSite
351.83e-04AAAGGTATTTGAAAGAATATTGAATT
1651.25e-03TAATATTATTGAAAAATACAATTTTA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000356 100.0 227 0 0 1 227 1 227 0.0 420
pORI00001180 99.561 228 0 1 1 227 1 228 0.0 414